RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
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CMTM4-204ENST00000563952 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
CMTM4-204ENST00000563952 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa29.4■■■□□ 2.3
CMTM4-204ENST00000563952 HYKKA2RU49 373 aa29.4■■■□□ 2.3
CMTM4-204ENST00000563952 MKRN2OSH3BPM6 223 aa29.4■■■□□ 2.3
CMTM4-204ENST00000563952 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
CMTM4-204ENST00000563952 OTX2P32243 289 aa29.4■■■□□ 2.3
CMTM4-204ENST00000563952 FOLR3P41439 243 aa29.4■■■□□ 2.3
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CMTM4-204ENST00000563952 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
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CMTM4-204ENST00000563952 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa29.4■■■□□ 2.3
CMTM4-204ENST00000563952 TLK1Q9UKI8 766 aa29.4■■■□□ 2.3
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC88CQ9P219 2028 aa29.4■■■□□ 2.3
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CMTM4-204ENST00000563952 HIST1H2ADP20671 130 aa29.39■■■□□ 2.3
CMTM4-204ENST00000563952 ITGAXP20702 1163 aa29.39■■■□□ 2.3
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CMTM4-204ENST00000563952 HIST1H2AJQ99878 128 aa29.39■■■□□ 2.3
CMTM4-204ENST00000563952 H2AFJQ9BTM1 129 aa29.39■■■□□ 2.3
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CMTM4-204ENST00000563952 ENAMQ9NRM1 1142 aa29.39■■■□□ 2.3
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CMTM4-204ENST00000563952 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
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CMTM4-204ENST00000563952 AGTRAPQ6RW13 159 aa29.38■■■□□ 2.29
CMTM4-204ENST00000563952 RAB43Q86YS6 212 aa29.38■■■□□ 2.29
CMTM4-204ENST00000563952 DTWD1Q8N5C7 304 aa29.38■■■□□ 2.29
CMTM4-204ENST00000563952 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
CMTM4-204ENST00000563952 ACSS2Q9NR19 701 aa29.38■■■□□ 2.29
CMTM4-204ENST00000563952 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa29.38■■■□□ 2.29
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CMTM4-204ENST00000563952 SYNPO2LQ9H987 977 aa29.37■■■□□ 2.29
CMTM4-204ENST00000563952 ARL15Q9NXU5 204 aa29.37■■■□□ 2.29
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CMTM4-204ENST00000563952 ZNF462Q96JM2 2506 aa29.37■■■□□ 2.29
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CMTM4-204ENST00000563952 TMEM151BQ8IW70 566 aa29.35■■■□□ 2.29
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CMTM4-204ENST00000563952 VPS39Q96JC1 886 aa29.35■■■□□ 2.29
CMTM4-204ENST00000563952 LRRC1Q9BTT6 524 aa29.35■■■□□ 2.29
CMTM4-204ENST00000563952 PCBD2Q9H0N5 130 aa29.35■■■□□ 2.29
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