RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	C1S	P09871	688 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	HTR1B	P28222	390 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	KDELR2	P33947	212 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	GAREM2	Q75VX8	874 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	HORMAD1	Q86X24	394 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	VRK3	Q8IV63	474 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	RORB	Q92753	470 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	LMLN	Q96KR4	655 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	MYO1D	O94832	1006 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	UGT2B4	P06133	528 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	HSD3B1	P14060	373 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	COX7A2	P14406	83 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF30	P17039	623 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ITPKA	P23677	461 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	HSD3B2	P26439	372 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	OCA2	Q04671	838 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	VEZF1	Q14119	521 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ATL1	Q8WXF7	558 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	VNN3	Q9NY84	501 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SPG21	Q9NZD8	308 aa		17.85	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	DPM1	O60762	260 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	JRK	O75564	520 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SEMG1	P04279	462 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	PFN3	P60673	137 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	PHEX	P78562	749 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CREM	Q03060	361 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SLC14A1	Q13336	389 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	UGT8	Q16880	541 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SLC15A4	Q8N697	577 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ELMO1	Q92556	727 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF347	Q96SE7	839 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	DUSP21	Q9H596	190 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	COL4A6	Q14031	1691 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	QSOX1	O00391	747 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SLC22A1	O15245	554 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	INMT	O95050	263 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	B3GALT4	O96024	378 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-F	P30511	346 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	DAP	P51397	102 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	PIGF	Q07326	219 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	NR1D2	Q14995	579 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CBLL1	Q75N03	491 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	GPR65	Q8IYL9	337 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CPA6	Q8N4T0	437 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	FAR1	Q8WVX9	515 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	TIFA	Q96CG3	184 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		17.84	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	LEFTY2	O00292	366 aa		17.83	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	TEX28	O15482	410 aa		17.83	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	PRAMEF4	O60810	478 aa		17.83	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SCN2B	O60939	215 aa		17.83	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	17.83	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	AOC2	O75106	756 aa		17.83	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SLCO2B1	O94956	709 aa		17.83	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	GSTM1	P09488	218 aa		17.83	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	OCM2	P0CE71	109 aa		17.83	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	17.83	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	17.83	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	LAG3	P18627	525 aa		17.83	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	HNF4A	P41235	474 aa		17.83	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ASMT	P46597	345 aa		17.83	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	DCDC1	P59894	354 aa		17.83	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		17.83	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SPCS2	Q15005	226 aa		17.83	■□□□□ 0.45

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