RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ATCAYQ86WG3 371 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 C17orf64Q86WR6 236 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 DENND6AQ8IWF6 608 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TCAIMQ8N3R3 496 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 DNAJC22Q8N4W6 341 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 EFCAB3Q8N7B9 438 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 OR1L3Q8NH93 324 aa5.38□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 NAT14Q8WUY8 206 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CABS1Q96KC9 395 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CPNE1Q99829 537 aa5.38□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A23Q9BV35 468 aa5.38□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 CHST8Q9H2A9 424 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 POPDC3Q9HBV1 291 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF304Q9HCX3 659 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa5.38□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 CUTCQ9NTM9 273 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM184CQ9NVA4 438 aa5.38□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 ARL15Q9NXU5 204 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SPHK1Q9NYA1 384 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PLAGL1Q9UM63 463 aa5.38□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 CHMP2BQ9UQN3 213 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CDYLQ9Y232 598 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 DYRK1BQ9Y463 629 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SDK2Q58EX2 2172 aa5.38□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 HYKKA2RU49 373 aa5.37□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 SYCE1LA8MT33 242 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGEF33A8MVX0 844 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 E7ENX8 843 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 E7ESA3 106 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC16A8O95907 504 aa5.37□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC35G6P0C7Q6 338 aa5.37□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC26A3P40879 764 aa5.37□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 BDKRB1P46663 353 aa5.37□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 CDKL1Q00532 357 aa5.37□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 TAP2Q03519 686 aa5.37□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 TGM3Q08188 693 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 GPS2Q13227 327 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM53BQ14153 422 aa5.37□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 HERC3Q15034 1050 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
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CLSTN3-215ENST00000544584 CDKL4Q5MAI5 379 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 WASHC2DQ5SRD0 308 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 GRTP1Q5TC63 336 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 LGSNQ5TDP6 509 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 HECTD2Q5U5R9 776 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 LCTLQ6UWM7 567 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SYT10Q6XYQ8 523 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ASB18Q6ZVZ8 466 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ABHD13Q7L211 337 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CTAGE6Q86UF2 777 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM73Q86UV7 250 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TAX1BP1Q86VP1 789 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 VRK3Q8IV63 474 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CTAGE4Q8IX94 777 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CTAGE3PQ8IX95 158 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT78Q8N1N4 520 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
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