RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529895.1

BBS1-216, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, humanhuman

TSL 2

Gene BBS1, Length 560 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1-216ENST00000529895 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 PRAMEF4O60810 478 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 ALDH3A1P30838 453 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 ARL4DP49703 201 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 HSD11B2P80365 405 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 FOXC1Q12948 553 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 GTF2H2Q13888 395 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 KCNAB1Q14722 419 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 PCLAFQ15004 111 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 PDK4Q16654 411 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 ZNF678Q5SXM1 525 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 ZNF425Q6IV72 752 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 FBXO42Q6P3S6 717 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 PAQR7Q86WK9 346 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 KMT5CQ86Y97 462 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 TCTN2Q96GX1 697 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 TMEM237Q96Q45 408 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 MECRQ9BV79 373 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 PDE7BQ9NP56 450 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 OXSMQ9NWU1 459 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 OCIAD1Q9NX40 245 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 MID2Q9UJV3 735 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 PCTPQ9UKL6 214 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 SNX7Q9UNH6 387 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 OR2A25A4D2G3 310 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 E7EQ34 232 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 HGSO14964 777 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 HCRTR1O43613 425 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 ZWINTO95229 277 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 BPGMP07738 259 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 RPS17P08708 135 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 EBLN1P0CF75 366 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 CCL4P13236 92 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 FOLR1P15328 257 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 EPB42P16452 691 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 GNAZP19086 355 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 CDH13P55290 713 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 DNAJB13P59910 316 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 HERVK_113P63132 956 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 SH3BP2P78314 561 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 CSNK1G2P78368 415 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 ADCK2Q7Z695 626 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 D2HGDHQ8N465 521 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 AGBL5Q8NDL9 886 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 CCDC126Q96EE4 140 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 L3HYPDHQ96EM0 354 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 BTRCQ9Y297 605 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.65□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 CCDC187A0A096LP49 1063 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 WDR91A4D1P6 747 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 EFCAB7A8K855 629 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 CLGNO14967 610 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 MAP3K7O43318 606 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 CTSVO60911 334 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 SUPT7LO94864 414 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 HGFP14210 728 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 TSPAN8P19075 237 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 HRH2P25021 359 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 SERPINB4P48594 390 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 CCR8P51685 355 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 SLC18A1P54219 525 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 NAGLUP54802 743 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 LIPMQ5VYY2 423 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms