RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519596.5

PABPC1-211, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 771 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-211	ENST00000519596	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	DCLK3	Q9C098	648 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	CUEDC2	Q9H467	287 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	C12orf10	Q9HB07	376 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	USP29	Q9HBJ7	922 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	SPG21	Q9NZD8	308 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	KCND3	Q9UK17	655 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	PROCR	Q9UNN8	238 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PABPC1-211	ENST00000519596	UBE4B	O95155	1302 aa		2.59	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		2.59	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	ADCY9	O60503	1353 aa		2.59	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	PTCH1	Q13635	1447 aa		2.59	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596		A0A0U1RQV5	110 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	BTBD17	A6NE02	478 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	HELT	A6NFD8	242 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	BECN2	A8MW95	431 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	MEI4	A8MW99	385 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596		K7EQM0	130 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	GRM8	O00222	908 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	HS3ST1	O14792	307 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	PCDH17	O14917	1159 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	INPPL1	O15357	1258 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	AVIL	O75366	819 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	MED24	O75448	989 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	TOM1L1	O75674	476 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	CLPX	O76031	633 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	PDE5A	O76074	875 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	IL1B	P01584	269 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	STAG3L2	P0CL84	134 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	COX7A2	P14406	83 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	CTPS1	P17812	591 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	S100A1	P23297	94 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	RBL1	P28749	1068 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	SLC5A2	P31639	672 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	RORA	P35398	523 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	PBX3	P40426	434 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	ARHGDIA	P52565	204 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	THOP1	P52888	689 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	AIF1	P55008	147 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	CDH6	P55285	790 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	CLDN8	P56748	225 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	PSMC5	P62195	406 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	GPC5	P78333	572 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	GCNT1	Q02742	428 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	CFHR1	Q03591	330 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	MERTK	Q12866	999 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	SPP2	Q13103	211 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	TDG	Q13569	410 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	ACOX1	Q15067	660 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	PDK3	Q15120	406 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	PON2	Q15165	354 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	ALX1	Q15699	326 aa		2.58	□□□□□ -2
PABPC1-211	ENST00000519596	ST3GAL2	Q16842	350 aa		2.58	□□□□□ -2

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