RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNAB2Q13303 367 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 LCN10Q6JVE6 187 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF44Q7L0R7 432 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 EXD3Q8N9H8 876 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD7Q92527 254 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 GBP5Q96PP8 586 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 RUFY1Q96T51 708 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 POPDC3Q9HBV1 291 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 GPAMQ9HCL2 828 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC6A20Q9NP91 592 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 STARD5Q9NSY2 213 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 TUBD1Q9UJT1 453 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 ESYT3A0FGR9 886 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 DSCR3O14972 297 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 CTSBP07858 339 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 GP5P40197 560 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 RELAQ04206 551 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 NAE1Q13564 534 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 USP10Q14694 798 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 TRADDQ15628 312 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 FBXO42Q6P3S6 717 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM198BQ6UWH4 519 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 RAB43Q86YS6 212 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 SPNS2Q8IVW8 549 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 CEP112Q8N8E3 955 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 HAUS8Q9BT25 410 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM184CQ9NVA4 438 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNMB2Q9Y691 235 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM159BA6NKW6 160 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 MKRN2OSH3BPM6 223 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 H7BY64 318 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 GUCA1CO95843 209 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 TSPAN12O95859 305 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 PHBP35232 272 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 GRK3P35626 688 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 FOLR3P41439 243 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 TAS2R39P59534 338 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 TBPL1P62380 186 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 MUM1Q2TAK8 710 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 GRTP1Q5TC63 336 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 FRMPD2BQ6IN97 320 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 FRA10AC1Q70Z53 315 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 PAQR7Q86WK9 346 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 C17orf64Q86WR6 236 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF843Q8N446 348 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 PPM1NQ8N819 430 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 CABS1Q96KC9 395 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF285Q96NJ3 590 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 PRAP1Q96NZ9 151 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC25A18Q9H1K4 315 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 SMYD2Q9NRG4 433 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 CDC14AQ9UNH5 594 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 FITM1A5D6W6 292 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 H0YGG7 62 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 CAPN1P07384 714 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 FURINP09958 794 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 STMN1P16949 149 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 GPX6P59796 221 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 YBX1P67809 324 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 NAB1Q13506 487 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 SSPNQ14714 243 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC9A5Q14940 896 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 PHKG1Q16816 387 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 OR4N4Q8N0Y3 316 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 CSNK1A1LQ8N752 337 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 IFT81Q8WYA0 676 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 COL26A1Q96A83 441 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 IP6K3Q96PC2 410 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 RBBP8Q99708 897 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 SEMA4CQ9C0C4 833 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 ENAMQ9NRM1 1142 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 SEC16AO15027 2179 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.824e-6■■□□□ 14
SH3BP2-210ENST00000505941 RFPL1O75677 317 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 PIAS1O75925 651 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 ALBP02768 609 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 ANXA5P08758 320 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 PGGT1BP53609 377 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms