RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 PELI2Q9HAT8 420 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 TUFT1Q9NNX1 390 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 TMEM161AQ9NX61 479 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 WWOXQ9NZC7 414 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 APPL1Q9UKG1 709 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
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CCL20-204ENST00000489160 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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CCL20-204ENST00000489160 GHRP10912 638 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 GNAZP19086 355 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 CYP11B2P19099 503 aa4.59□□□□□ -1.67
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CCL20-204ENST00000489160 HTD2P86397 168 aa4.59□□□□□ -1.67
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CCL20-204ENST00000489160 CUL3Q13618 768 aa4.59□□□□□ -1.67
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CCL20-204ENST00000489160 INAQ16352 499 aa4.59□□□□□ -1.67
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CCL20-204ENST00000489160 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 CNTN4Q8IWV2 1026 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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CCL20-204ENST00000489160 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 HSD17B8Q92506 261 aa4.59□□□□□ -1.67
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CCL20-204ENST00000489160 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 ZNF354BQ96LW1 612 aa4.59□□□□□ -1.67
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CCL20-204ENST00000489160 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa4.59□□□□□ -1.67
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CCL20-204ENST00000489160 SPHK1Q9NYA1 384 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 TAS2R3Q9NYW6 316 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 NINJ2Q9NZG7 142 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 TBC1D7Q9P0N9 293 aa4.59□□□□□ -1.67
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CCL20-204ENST00000489160 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 FBXL5Q9UKA1 691 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-204ENST00000489160 RNF150Q9ULK6 438 aa4.59□□□□□ -1.67
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CCL20-204ENST00000489160 PIGNO95427 931 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 FAM86B2P0C5J1 330 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SMIM18P0DKX4 95 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SAGP10523 405 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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CCL20-204ENST00000489160 CHRNA7P36544 502 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 DCTP40126 519 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 WNT5AP41221 380 aa4.58□□□□□ -1.68
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CCL20-204ENST00000489160 TECRLQ5HYJ1 363 aa4.58□□□□□ -1.68
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CCL20-204ENST00000489160 DPH5Q9H2P9 285 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 FZD8Q9H461 694 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 FN3KQ9H479 309 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 MINDY3Q9H8M7 445 aa4.58□□□□□ -1.68
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