RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 PLCD4Q9BRC7 762 aa25.4■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 SGPP1Q9BX95 441 aa25.4■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 SYNPO2LQ9H987 977 aa25.4■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 PCMTD2Q9NV79 361 aa25.4■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 OARD1Q9Y530 152 aa25.4■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 CCNYL3P0C7X3 344 aa25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 RORAP35398 523 aa25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 DLSTP36957 453 aa25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 DLG1Q12959 904 aa25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 LCN10Q6JVE6 187 aa25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 DSELQ8IZU8 1212 aa25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 OR56A3Q8NH54 315 aa25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 PTERQ96BW5 349 aa25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 RUFY1Q96T51 708 aa25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 SELENOSQ9BQE4 189 aa25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 EPB41L4BQ9H329 900 aa25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 STARD5Q9NSY2 213 aa25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4-202ENST00000483873 SEC16AO15027 2179 aa25.39■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 TERTO14746 1132 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 RIPK2O43353 540 aa25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 ABATP80404 500 aa25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 NAA25Q14CX7 972 aa25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 OR4D1Q15615 310 aa25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 PTCHD3Q3KNS1 767 aa25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 FBXO42Q6P3S6 717 aa25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 FRA10AC1Q70Z53 315 aa25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 GPR155Q7Z3F1 870 aa25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 MR1Q95460 341 aa25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 LRFN5Q96NI6 719 aa25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 SNX15Q9NRS6 342 aa25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKMY1Q9P2S6 941 aa25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 MEN1O00255 615 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 TUBBP07437 444 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 INHBAP08476 426 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 TCN2P20062 427 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 CRABP2P29373 138 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 CSRP3P50461 194 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 ADCK2Q7Z695 626 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 OR4N4Q8N0Y3 316 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF285Q96NJ3 590 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 EGFL8Q99944 293 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 CHST8Q9H2A9 424 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 H7BY64 318 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 HAT1O14929 419 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 CTIFO43310 598 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 ABHD2P08910 425 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 CYP4F2P78329 520 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 IRF9Q00978 393 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 C1orf189Q5VU69 101 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 TLDC1Q6P9B6 456 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 EMBQ6PCB8 327 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 LCTLQ6UWM7 567 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 PLD3Q8IV08 490 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 DCAKDQ8WVC6 231 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 ATL1Q8WXF7 558 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 PRAP1Q96NZ9 151 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 OR4K3Q96R72 315 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 PCBD2Q9H0N5 130 aa25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 CCDC88CQ9P219 2028 aa25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 ANXA5P08758 320 aa25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 ATXN8OSP0DMR3 200 aa25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 NPPBP16860 134 aa25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 CCND1P24385 295 aa25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 GCGRP47871 477 aa25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 ATP6V0D1P61421 351 aa25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 CDKL1Q00532 357 aa25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 DNASE1L3Q13609 305 aa25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 TGFBIQ15582 683 aa25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 RHBDD2Q6NTF9 364 aa25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 C17orf64Q86WR6 236 aa25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 MYRIPQ8NFW9 859 aa25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC45A3Q96JT2 553 aa25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 IGSF5Q9NSI5 407 aa25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 SNX7Q9UNH6 387 aa25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 C2P06681 752 aa25.35■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 HBQ1P09105 142 aa25.35■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 CDH1P12830 882 aa25.35■■□□□ 1.65
GTF3C4-202ENST00000483873 MSH2P43246 934 aa25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms