RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 SPHK1Q9NYA1 384 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 TRPS1Q9UHF7 1281 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 HAO1Q9UJM8 370 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 ASB1Q9Y576 335 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 MYO15AQ9UKN7 3530 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 LRRC14BA6NHZ5 514 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 GDF9O60383 454 aa12.55□□□□□ -0.4
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NISCH-208ENST00000481211 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 FGF4P08620 206 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD34CP0C6C1 535 aa12.55□□□□□ -0.4
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NISCH-208ENST00000481211 BST1Q10588 318 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 CHIT1Q13231 466 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 RBBP7Q16576 425 aa12.55□□□□□ -0.4
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NISCH-208ENST00000481211 FBXO48Q5FWF7 155 aa12.55□□□□□ -0.4
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NISCH-208ENST00000481211 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 GRHL2Q6ISB3 625 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 IRGCQ6NXR0 463 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 MILR1Q7Z6M3 343 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 TMPRSS11BQ86T26 416 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 KRT78Q8N1N4 520 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 TTLQ8NG68 377 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 TRPC4APQ8TEL6 797 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 AGAP11Q8TF27 550 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 THAP11Q96EK4 314 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 FAR2Q96K12 515 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 AIF1LQ9BQI0 150 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 ACAT2Q9BWD1 397 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 SLC29A3Q9BZD2 475 aa12.55□□□□□ -0.4
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NISCH-208ENST00000481211 NT5DC2Q9H857 520 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 PDP2Q9P2J9 529 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 ADGRE2Q9UHX3 823 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 RAP2CQ9Y3L5 183 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD12Q6UB98 2062 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 E7EQ34 232 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 SLCO1B7G3V0H7 640 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 OR7A17O14581 309 aa12.54□□□□□ -0.4
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NISCH-208ENST00000481211 JUPP14923 745 aa12.54□□□□□ -0.4
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NISCH-208ENST00000481211 CDH3P22223 829 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 CDH13P55290 713 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 OCRLQ01968 901 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 TRAF3Q13114 568 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 SPIDRQ14159 915 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 AMZ1Q400G9 498 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
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NISCH-208ENST00000481211 RNF165Q6ZSG1 346 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 CUZD1Q86UP6 607 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 FAM129CQ86XR2 697 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 TCTN2Q96GX1 697 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 CCT7Q99832 543 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 PLCD4Q9BRC7 762 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 DPH7Q9BTV6 452 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 MID1IP1Q9NPA3 183 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 PFDN4Q9NQP4 134 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 A0A1W2PQM1 296 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 TRBC2A0A5B9 178 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 OR2A25A4D2G3 310 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 D6RAR5 112 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 H0YIV9 168 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 CRCPO75575 148 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 CHEK2O96017 543 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 KRT6AP02538 564 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 KRT6BP04259 564 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 MSL3P1P0C860 447 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 UROSP10746 265 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 CDH1P12830 882 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 CEACAM1P13688 526 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 HGFP14210 728 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 PSMB5P28074 263 aa12.53□□□□□ -0.4
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