RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467983.1

ABCB4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 414 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-208	ENST00000467983	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ANKFN1	Q8N957	763 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM143	Q96AN5	459 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RBBP8	Q99708	897 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DRC3	Q9H069	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	C8orf4	Q9NR00	106 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	OLAH	Q9NV23	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ADA2	Q9NZK5	511 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983		A0A096LPK6	155 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	FBP2	O00757	339 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	GRID2	O43424	1007 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	SNAP91	O60641	907 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	CABYR	O75952	493 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	PIGN	O95427	931 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	POLB	P06746	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	VDR	P11473	427 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	CDH3	P22223	829 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	IL4R	P24394	825 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	DNAJB1	P25685	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	DCK	P27707	260 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	HOXD12	P35452	270 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	HADHA	P40939	763 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	TNFSF9	P41273	254 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	GRIA1	P42261	906 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	HAL	P42357	657 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	DPP6	P42658	865 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	EFNA5	P52803	228 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	CDH15	P55291	814 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	ACTR2	P61160	394 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	YPEL5	P62699	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	RHD	Q02161	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	MTAP	Q13126	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	STX5	Q13190	355 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	SQLE	Q14534	574 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	TGFBI	Q15582	683 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	CDO1	Q16878	200 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	MIDN	Q504T8	468 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB4-208	ENST00000467983	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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