RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466624.1

GPC1-207, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 782 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-207ENST00000466624 RAB11FIP2Q7L804 512 aa15.38■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa15.38■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ABHD11Q8NFV4 315 aa15.38■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 SLC5A11Q8WWX8 675 aa15.38■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 PHF21BQ96EK2 531 aa15.38■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 PLCD4Q9BRC7 762 aa15.38■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 DPH7Q9BTV6 452 aa15.38■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 PELI2Q9HAT8 420 aa15.38■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ABCF3Q9NUQ8 709 aa15.38■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 SOHLH2Q9NX45 425 aa15.38■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 COPG2Q9UBF2 871 aa15.38■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 LOXL2Q9Y4K0 774 aa15.38■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 CACNA1AO00555 2505 aa15.38■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 DYNC1I1O14576 645 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 RPS17P08708 135 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 CPA3P15088 417 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 AGTR2P50052 363 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 SLC18A1P54219 525 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 PRKAA2P54646 552 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 HERVK_113P63132 956 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 YBX1P67809 324 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ACY1Q03154 408 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 E2F2Q14209 437 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ZIC1Q15915 447 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 FBXO48Q5FWF7 155 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 PAQR7Q86WK9 346 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 FAM20CQ8IXL6 584 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 BMPERQ8N8U9 685 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 CCDC63Q8NA47 563 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 OR4K1Q8NGD4 311 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 NEIL2Q969S2 332 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ESAMQ96AP7 390 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 L3HYPDHQ96EM0 354 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 FAM111AQ96PZ2 611 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ERVK-6Q9BXR3 956 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 NRSN2Q9GZP1 204 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 EHD1Q9H4M9 534 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 SLC17A7Q9P2U7 560 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 SH2B3Q9UQQ2 575 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ASB1Q9Y576 335 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa15.37■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 FAM149AA5PLN7 773 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 E2F3O00716 465 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 PLD2O14939 933 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 CLGNO14967 610 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 KATNA1O75449 491 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ZWINTO95229 277 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 CDH1P12830 882 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 EZRP15311 586 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 EPB42P16452 691 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 IMPDH1P20839 514 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ETV4P43268 484 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 GABRA4P48169 554 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 CCR8P51685 355 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 DNAJB13P59910 316 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 MC2RQ01718 297 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 CAMK2BQ13554 666 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 IGF2-ASQ6U949 168 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 RNF44Q7L0R7 432 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 DNAJC22Q8N4W6 341 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ARMC2Q8NEN0 867 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ARL8AQ96BM9 186 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ZBTB9Q96C00 473 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 WDR34Q96EX3 536 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 SARGQ9BW04 601 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 B3GNT4Q9C0J1 378 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 FBXO8Q9NRD0 319 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ENAMQ9NRM1 1142 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 OXSMQ9NWU1 459 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 PILRAQ9UKJ1 303 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 PCTPQ9UKL6 214 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 SPTBN2O15020 2390 aa15.36■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 EFCAB7A8K855 629 aa15.35■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 H7BY64 318 aa15.35■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 EPORP19235 508 aa15.35■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 CASP2P42575 452 aa15.35■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 RAB15P59190 212 aa15.35■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 CSNK1G2P78368 415 aa15.35■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 GTF2H2Q13888 395 aa15.35■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 IL11RAQ14626 422 aa15.35■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 PCLAFQ15004 111 aa15.35■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 TBCCQ15814 346 aa15.35■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 TTMPQ5BVD1 217 aa15.35■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ZNF678Q5SXM1 525 aa15.35■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 ATG9BQ674R7 924 aa15.35■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa15.35■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 NXPE4Q6UWF7 544 aa15.35■□□□□ 0.05
GPC1-207ENST00000466624 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms