RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR1	P46091	355 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ALDH3B2	P48448	385 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GABARAPL2	P60520	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PGS1	Q32NB8	556 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	NADK2	Q4G0N4	442 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT78	Q8N1N4	520 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SUSD6	Q92537	303 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SNX19	Q92543	992 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SMARCD2	Q92925	531 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	VOPP1	Q96AW1	172 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PYURF	Q96I23	114 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PHF12	Q96QT6	1004 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PANX1	Q96RD7	426 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	HDAC8	Q9BY41	377 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ING2	Q9H160	280 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	VPS4A	Q9UN37	437 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CKAP5	Q14008	2032 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	LINC01553	A4QN01	128 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	OR2AG2	A6NM03	316 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	FPGT	O14772	594 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ACOX3	O15254	700 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	E2F6	O75461	281 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	IFNA14	P01570	189 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	EPCAM	P16422	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CEBPB	P17676	345 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GPX2	P18283	190 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	KEL	P23276	732 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ITPKA	P23677	461 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CA5A	P35218	305 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PIK3CB	P42338	1070 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	NUP107	P57740	925 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	LSAMP	Q13449	338 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	NAE1	Q13564	534 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TUBA3C	Q13748	450 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBED5	Q49AG3	693 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CPTP	Q5TA50	214 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CPZ	Q66K79	652 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM215	Q68D42	235 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF786	Q8N393	782 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	NAT16	Q8N8M0	369 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SCAMP4	Q969E2	229 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TMBIM1	Q969X1	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	MED8	Q96G25	268 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	APOLD1	Q96LR9	279 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	QRFPR	Q96P65	431 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TSSK3	Q96PN8	268 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	HBEGF	Q99075	208 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DUSP26	Q9BV47	211 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	MYO10	Q9HD67	2058 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	NUMA1	Q14980	2115 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	CLIC1	O00299	241 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	AREL1	O15033	823 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	UGT2B11	O75310	529 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	C1orf105	O95561	183 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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