RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SPATA7Q9P0W8 599 aa9□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FBXL4Q9UKA2 621 aa9□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SOX13Q9UN79 622 aa9□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MRFAP1Q9Y605 127 aa9□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR2A25A4D2G3 310 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 WIPF3A6NGB9 483 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GOLGA8KD6RF30 607 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 H3BMM5 538 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GOLGA8TH3BQL2 631 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MYO1CO00159 1063 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NIPSNAP2O75323 286 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 VAPBO95292 243 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MED26O95402 600 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CBX6O95503 412 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ESR1P03372 595 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 THBS1P07996 1170 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MSX1P28360 303 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KCNJ1P48048 391 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KCNJ11Q14654 390 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM214AQ32MH5 1076 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 WASHC2DQ5SRD0 308 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FRMPD2BQ6IN97 320 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MRNIPQ6NTE8 343 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CNSTQ6PJW8 725 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CES3Q6UWW8 571 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GSTA5Q7RTV2 222 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CUZD1Q86UP6 607 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAB42Q8N4Z0 105 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRELID2Q8N945 189 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MAGEC3Q8TD91 643 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MAIP1Q8WWC4 291 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FOPNLQ96NB1 174 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TCF12Q99081 682 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MIPEPQ99797 713 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RUBCNLQ9H714 662 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ASF1BQ9NVP2 202 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CDC23Q9UJX2 597 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM169AQ9Y6X4 670 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.99□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HYKKA2RU49 373 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ARHGEF33A8MVX0 844 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ALOX12BO75342 701 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DDAH2O95865 285 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCDC175P0C221 793 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OGNP20774 298 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ITGA3P26006 1051 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FMO4P31512 558 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR1D4P47884 311 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 YBX1P67809 324 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NAA25Q14CX7 972 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRTGQ2VWP7 1150 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRMT9Q6P2P2 845 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CENPUQ71F23 418 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR4N4Q8N0Y3 316 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZADH2Q8N4Q0 377 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRIM58Q8NG06 486 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR11G2Q8NGC1 345 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C10orf90Q96M02 699 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LZTFL1Q9NQ48 299 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HOMER3Q9NSC5 361 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GALPQ9UBC7 116 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CSAG2Q9Y5P2 127 aa8.98□□□□□ -0.97
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms