RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 IL12RB2Q99665 862 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 AKTIPQ9H8T0 292 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 HPF1Q9NWY4 346 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 J3QRK9 145 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMD9O00233 223 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 B3GALT2O43825 422 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 INMTO95050 263 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 IFI30P13284 250 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SELPP16109 830 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 S100A2P29034 98 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PTGS2P35354 604 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ERVK-21P61565 698 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 RHDQ02161 417 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF366Q8N895 744 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 OR13C4Q8NGS5 318 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 RIT1Q92963 219 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ACDQ96AP0 544 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXL8Q96CD0 374 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FUZQ9BT04 418 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SRMSQ9H3Y6 488 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 EHD1Q9H4M9 534 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 POFUT2Q9Y2G5 429 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0G2JN53 185 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 A8MT66 165 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 GNB5O14775 395 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 HLA-DPB1P04440 258 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 H1F0P07305 194 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ACVR2AP27037 513 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CCKBRP32239 447 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 NFKB2Q00653 900 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CAP1Q01518 475 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 XKR4Q5GH76 650 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 RGMBQ6NW40 437 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SYCE2Q6PIF2 218 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 GHDCQ8N2G8 530 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 NATD1Q8N6N6 113 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 B3GNT4Q9C0J1 378 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ZIM2Q9NZV7 527 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 MYH2Q9UKX2 1941 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SIPA1L1O43166 1804 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 BRWD1Q9NSI6 2320 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 HAS3O00219 553 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 NUDT6P53370 316 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 DSTNP60981 165 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 DNASE1L3Q13609 305 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCA11PQ4W5N1 156 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FRG2Q64ET8 278 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ARMC5Q96C12 935 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FRG2BQ96QU4 278 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 HAPLN3Q96S86 360 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 NEUROD4Q9HD90 331 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CENPMQ9NSP4 180 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM9Q9P0T7 183 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 HCN3Q9P1Z3 774 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 GALPQ9UBC7 116 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC42Q9Y546 428 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM150CB9EJG8 249 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 M0QX08 132 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TLR4O00206 839 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 IRAK2O43187 625 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 IFNA21P01568 189 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 OPN1SWP03999 348 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 LMO2P25791 158 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 HOXC12P31275 282 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 GDI2P50395 445 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 DGKQP52824 942 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBA1BP68363 451 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 MAB21L1Q13394 359 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBA1AQ71U36 451 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SYVN1Q86TM6 617 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TTLQ8NG68 377 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SLCO2A1Q92959 643 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PKP4Q99569 1192 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ACTR3BQ9P1U1 418 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 OR51F1A6NGY5 319 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 H3BSA7 217 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 APLP1P51693 650 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PGDP52209 483 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 IRF9Q00978 393 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CD83Q01151 205 aa10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms