RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 ST6GAL1P15907 406 aa6.29□□□□□ -1.4
USP40-202ENST00000409945 RRM1P23921 792 aa6.29□□□□□ -1.4
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USP40-202ENST00000409945 TPI1P60174 286 aa6.29□□□□□ -1.4
USP40-202ENST00000409945 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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USP40-202ENST00000409945 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.29□□□□□ -1.4
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USP40-202ENST00000409945 HDAC4P56524 1084 aa6.28□□□□□ -1.4
USP40-202ENST00000409945 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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USP40-202ENST00000409945 FHL2Q14192 279 aa6.28□□□□□ -1.4
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