RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 STSP08842 583 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-204ENST00000403441 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP11.79□□□□□ -0.525e-44■■■□□ 15.1
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PRAME-204ENST00000403441 TTPAP49638 278 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-204ENST00000403441 ADARP55265 1226 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PRAME-204ENST00000403441 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
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PRAME-204ENST00000403441 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
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PRAME-204ENST00000403441 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
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PRAME-204ENST00000403441 KLC1Q07866 573 aa11.78□□□□□ -0.52
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PRAME-204ENST00000403441 WASHC2DQ5SRD0 308 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-204ENST00000403441 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PRAME-204ENST00000403441 FJX1Q86VR8 437 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-204ENST00000403441 LRRC6Q86X45 466 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-204ENST00000403441 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-204ENST00000403441 OR1N1Q8NGS0 311 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-204ENST00000403441 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PRAME-204ENST00000403441 CAPZA3Q96KX2 299 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-204ENST00000403441 TCF12Q99081 682 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-204ENST00000403441 MIPEPQ99797 713 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-204ENST00000403441 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PRAME-204ENST00000403441 COPG2Q9UBF2 871 aa11.78□□□□□ -0.52
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PRAME-204ENST00000403441 VAPBO95292 243 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ZGLP1P0C6A0 271 aa11.77□□□□□ -0.53
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PRAME-204ENST00000403441 GBX1Q14549 363 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PPP1R7Q15435 360 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa11.77□□□□□ -0.53
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PRAME-204ENST00000403441 CES3Q6UWW8 571 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CENPUQ71F23 418 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PCGF5Q86SE9 256 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PRSS58Q8IYP2 241 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
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PRAME-204ENST00000403441 STT3BQ8TCJ2 826 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa11.77□□□□□ -0.53
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PRAME-204ENST00000403441 RAD51AP1Q96B01 352 aa11.77□□□□□ -0.53
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PRAME-204ENST00000403441 PANX3Q96QZ0 392 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PLAC1Q9HBJ0 212 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CSMD1Q96PZ7 3565 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 APCP25054 2843 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ZGRF1Q86YA3 2104 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PCDH17O14917 1159 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 KPNA5O15131 536 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 KLHL18O94889 574 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PRF1P14222 555 aa11.76□□□□□ -0.53
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