RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 CD300CQ08708 224 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GPNMBQ14956 572 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CDK10Q15131 360 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MAPK11Q15759 364 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PFKFB4Q16877 469 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PAGE3Q5JUK9 113 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ATG9BQ674R7 924 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RNF165Q6ZSG1 346 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OTOP3Q7RTS5 596 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DSG4Q86SJ6 1040 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 THEM5Q8N1Q8 247 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FNDC5Q8NAU1 212 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM145Q8NBT3 493 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FAM162AQ96A26 154 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PPP3R2Q96LZ3 170 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF382Q96SR6 550 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MED10Q9BTT4 135 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TKTL2Q9H0I9 626 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DPEP3Q9H4B8 488 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SIAEQ9HAT2 523 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TAS2R13Q9NYV9 303 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 VPS51Q9UID3 782 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CFL2Q9Y281 166 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SCN5AQ14524 2016 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CENPFP49454 3210 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MROH6A6NGR9 719 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CASTOR2A6NHX0 329 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 METTL15A6NJ78 407 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SUPT3HB4E1H0 165 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FAM72CH0Y354 149 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 H3BMM5 538 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TOR1BO14657 336 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ZW10O43264 779 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 AIREO43918 545 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 WISP1O95388 367 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MT-CO1P00395 513 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 IL6P05231 212 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 YES1P07947 543 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CD36P16671 472 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DCTP40126 519 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ECI1P42126 302 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NRIP1P48552 1158 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DIO3P55073 304 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 WNT3AP56704 352 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 VBP1P61758 197 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ACVR1Q04771 509 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FCHO2Q0JRZ9 810 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 E2F2Q14209 437 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 STARD3Q14849 445 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC26Q2I0M4 334 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM61Q5EBN2 209 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CLLU1OSQ5K130 101 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FAM72AQ5TYM5 149 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MLIPQ5VWP3 458 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SYPL2Q5VXT5 272 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 STEAP3Q658P3 488 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FAM72DQ6L9T8 149 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CLEC20AQ6ZU45 233 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GPR149Q86SP6 731 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 C11orf74Q86VG3 221 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FAM72BQ86X60 149 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 KRT73Q86Y46 540 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA22Q8NHS9 363 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 HTRA1Q92743 480 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ATOH8Q96SQ7 321 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ACBD6Q9BR61 282 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TUBB1Q9H4B7 451 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GP6Q9HCN6 339 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 STMN3Q9NZ72 180 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 BTBD3Q9Y2F9 522 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 EMC9Q9Y3B6 208 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 LTBP2Q14767 1821 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ASPDHA6ND91 283 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CXCR6O00574 342 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SYN3O14994 580 aa6.99□□□□□ -1.29
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