RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 GULP1Q9UBP9 304 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 VPS29Q9UBQ0 182 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 ELFN1P0C7U0 828 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 DCTP40126 519 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 TRPC1P48995 793 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 PMS2P3Q13401 168 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 E2F2Q14209 437 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 DUOXA1Q1HG43 343 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 SERPINA11Q86U17 422 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 ATL1Q8WXF7 558 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 SDCCAG3Q96C92 435 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 AP2M1Q96CW1 435 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 OCEL1Q9H607 264 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 EBF1Q9UH73 591 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 PCM1Q15154 2024 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 ETHE1O95571 254 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 SOD1P00441 154 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 CATP04040 527 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 XPAP23025 273 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 IRS1P35568 1242 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 PIGAP37287 484 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 METAP1P53582 386 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 ESRRGP62508 458 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 MYBPC3Q14896 1274 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 ADNP2Q6IQ32 1131 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 SPESP1Q6UW49 350 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 VN1R2Q8NFZ6 395 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 OR8J2Q8NGG1 315 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 OR5K1Q8NHB7 308 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 PYURFQ96I23 114 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 PKP4Q99569 1192 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM118AQ9NWS6 357 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 YY2O15391 372 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 NOBOXO60393 691 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 CPNE6O95741 557 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC16A8O95907 504 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 HSD3B1P14060 373 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 HSD3B2P26439 372 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 PDHA2P29803 388 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 HNF4AP41235 474 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 DGKGP49619 791 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 RAE1P78406 368 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB39AQ14964 217 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 DTD2Q96FN9 168 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 COQ10AQ96MF6 247 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 VNN3Q9NY84 501 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 CDC14AQ9UNH5 594 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 LAMA3Q16787 3333 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-202ENST00000335475 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 EPS8Q12929 822 aa20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 CAMK1Q14012 370 aa20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 ACOX1Q15067 660 aa20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF773Q6PK81 442 aa20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 XKR5Q6UX68 686 aa20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 THAP5Q7Z6K1 395 aa20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 NLRP8Q86W28 1048 aa20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 ZZZ3Q8IYH5 903 aa20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 MED8Q96G25 268 aa20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 BRF2Q9HAW0 419 aa20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 PSMD11O00231 422 aa20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 FPGTO14772 594 aa20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 B4GAT1O43505 415 aa20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 LILRB5O75023 590 aa20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 MESP2Q0VG99 397 aa20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 SPRED2Q7Z698 418 aa20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 EID3Q8N140 333 aa20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 PGBD3Q8N328 593 aa20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-202ENST00000335475 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 270.1 ms