RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 AQP12BA6NM10 295 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 ERGP11308 486 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 PCNAP12004 261 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 PAGE2BQ5JRK9 111 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 AQP12AQ8IXF9 295 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 OR8J3Q8NGG0 315 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 HUS1BQ8NHY5 278 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 IL17FQ96PD4 163 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 OR52E6Q96RD3 313 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
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HOXD8-201ENST00000313173 KANSL1LA0AUZ9 987 aa25.9■■□□□ 1.74
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HOXD8-201ENST00000313173 PEX1O43933 1283 aa25.9■■□□□ 1.74
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HOXD8-201ENST00000313173 ACP5P13686 325 aa25.9■■□□□ 1.74
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HOXD8-201ENST00000313173 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
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HOXD8-201ENST00000313173 PPP2CAP67775 309 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP19Q14CB8 494 aa25.9■■□□□ 1.74
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HOXD8-201ENST00000313173 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa25.9■■□□□ 1.74
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HOXD8-201ENST00000313173 LCTLQ6UWM7 567 aa25.9■■□□□ 1.74
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HOXD8-201ENST00000313173 EGFL7Q9UHF1 273 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 LRCH1Q9Y2L9 728 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 ARPC2O15144 300 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 HSD17B2P37059 387 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 GRIA3P42263 894 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 CLCNKAP51800 687 aa25.89■■□□□ 1.74
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HOXD8-201ENST00000313173 IER5LQ5T953 404 aa25.89■■□□□ 1.74
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HOXD8-201ENST00000313173 LILRA2Q8N149 483 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 GOLM1Q8NBJ4 401 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 MRGPRX1Q96LB2 322 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 PKP2Q99959 881 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 FZD3Q9NPG1 666 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 PPT2Q9UMR5 302 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 SNX13Q9Y5W8 968 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 S100A3P33764 101 aa25.88■■□□□ 1.73
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HOXD8-201ENST00000313173 LRRC36Q1X8D7 754 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 EOGTQ5NDL2 527 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 ACSM2BQ68CK6 577 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJB8Q8NHS0 232 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 SLCO4A1Q96BD0 722 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 HHIPQ96QV1 700 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 HAUS8Q9BT25 410 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 EBPLQ9BY08 206 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 SPATA7Q9P0W8 599 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PIPSLA2A3N6 862 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PRMT3O60678 531 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 MYO1DO94832 1006 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 ETHE1O95571 254 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 ACADMP11310 421 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 HTR1EP28566 365 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PLIN5Q00G26 463 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 LAPTM5Q13571 262 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 FAM124AQ86V42 546 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 IFNEQ86WN2 208 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PDSS2Q86YH6 399 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 SYT12Q8IV01 421 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D21Q8IYX1 336 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 VAPAQ9P0L0 249 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF839A8K0R7 811 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 SLC31A1O15431 190 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 DFNA5O60443 496 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PRPS1L1P21108 318 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 RPL10P27635 214 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PHC1P78364 1004 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 SELPLGQ14242 412 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 FBXO43Q4G163 708 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 BTBD1Q9H0C5 482 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD8-201ENST00000313173 PCM1Q15154 2024 aa25.87■■□□□ 1.73
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