RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 USP7Q93009 1102 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 PMEPA1Q969W9 287 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 SLC46A1Q96NT5 459 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 PRAP1Q96NZ9 151 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 TAAR9Q96RI9 348 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 FANCEQ9HB96 536 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO8Q9NRD0 319 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 SNX7Q9UNH6 387 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 CDH1P12830 882 aa21.45■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 RAB15P59190 212 aa21.45■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 SLC18A2Q05940 514 aa21.45■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 DCAF12Q5T6F0 453 aa21.45■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 CYB5D1Q6P9G0 228 aa21.45■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 PHF21BQ96EK2 531 aa21.45■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 PLCD4Q9BRC7 762 aa21.45■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 CD244Q9BZW8 370 aa21.45■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa21.45■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 RARRES3Q9UL19 164 aa21.45■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 GRID1Q9ULK0 1009 aa21.45■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 KLK4Q9Y5K2 254 aa21.45■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM150CB9EJG8 249 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 KLK8O60259 260 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 SBK3P0C264 359 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 CRHR1P34998 444 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 CYP4F3Q08477 520 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 IL11RAQ14626 422 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 SETDB1Q15047 1291 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 CEACAM20Q6UY09 585 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM151AQ8N4L1 468 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 SNX31Q8N9S9 440 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 SLC5A11Q8WWX8 675 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 NEIL2Q969S2 332 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 SMC6Q96SB8 1091 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJC11Q9NVH1 559 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 ANKMY1Q9P2S6 941 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 TMCO1Q9UM00 188 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 ASB1Q9Y576 335 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 KCNE2Q9Y6J6 123 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 SDK2Q58EX2 2172 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 UQCRHLA0A096LP55 91 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 OR2A25A4D2G3 310 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 HCRTR1O43613 425 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 CTSVO60911 334 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 UQCRHP07919 91 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF425Q6IV72 752 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 PAQR7Q86WK9 346 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 PPP1R3BQ86XI6 285 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJC22Q8N4W6 341 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 UBTD2Q8WUN7 234 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 APOPT1Q96IL0 206 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 DDA1Q9BW61 102 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 ASCL3Q9NQ33 180 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM184CQ9NVA4 438 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 OPTCQ9UBM4 332 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 EMCNQ9ULC0 261 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 CHD8Q9HCK8 2581 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 A0A0J9YVX5 310 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA6L10A6NI86 522 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 C9orf172C9J069 976 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 SPAG7O75391 227 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 DXOO77932 396 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 MYZAPP0CAP1 466 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 TAC1P20366 129 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 HRH2P25021 359 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 CDC16Q13042 620 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 PDK4Q16654 411 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 CATSPEREQ5SY80 951 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 IGF2-ASQ6U949 168 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 HDXQ7Z353 690 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 TMPRSS11BQ86T26 416 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 BANPQ8N9N5 519 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 MDM1Q8TC05 714 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 GATA6Q92908 595 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 RNF31Q96EP0 1072 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 FCRL4Q96PJ5 515 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 IRAK4Q9NWZ3 460 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 SENP1Q9P0U3 644 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 PLCL2Q9UPR0 1127 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC14BA6NHZ5 514 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 HAT1O14929 419 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 MSL3P1P0C860 447 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 FGF5P12034 268 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 GNAZP19086 355 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 SLC5A2P31639 672 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 GABRA4P48169 554 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 CCR8P51685 355 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC153Q494R4 210 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 PLD3Q8IV08 490 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms