RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM205Q6UW68 189 aa15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D21Q8IYX1 336 aa15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 DCUN1D1Q96GG9 259 aa15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 NPAS2Q99743 824 aa15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TUBB6Q9BUF5 446 aa15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GLOD4Q9HC38 313 aa15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ASF1AQ9Y294 204 aa15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GTH9 108 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 HYKKA2RU49 373 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 A8MUI8 341 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RASGRF2O14827 1237 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 AKR1B10O60218 316 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 MFAP3LO75121 409 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 NEURL1O76050 574 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RALBP11234 206 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PTPN3P26045 913 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ACADLP28330 430 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CDC25BP30305 580 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP25P42331 645 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 WNT3AP56704 352 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 DYNLT1P63172 113 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TAZQ16635 292 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 MFSD7Q6UXD7 560 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CHSY3Q70JA7 882 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 VSTM4Q8IW00 320 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RHOT2Q8IXI1 618 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PHC2Q8IXK0 858 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A41Q8N5S1 370 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 LINC01555Q8NAE3 123 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 MYRIPQ8NFW9 859 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 OR5K2Q8NHB8 316 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF354BQ96LW1 612 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 C10orf90Q96M02 699 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 C14orf105Q9NVL8 296 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 POLG2Q9UHN1 485 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 FKBPLQ9UIM3 349 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 HYOU1Q9Y4L1 999 aa15.53■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 FFAR3O14843 346 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 STX7O15400 261 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GPR42O15529 346 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 MAN1A2O60476 641 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CTSVO60911 334 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 EPOP01588 193 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PKLRP30613 574 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CD68P34810 354 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 NUP107P57740 925 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 XIAPP98170 497 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TCEAL1Q15170 157 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TEX44Q53QW1 395 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 WASHC2DQ5SRD0 308 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ARSKQ6UWY0 536 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RFX6Q8HWS3 928 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CRLF3Q8IUI8 442 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TMTC1Q8IUR5 882 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 OLFM1Q99784 485 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CRLS1Q9UJA2 301 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ARL5AQ9Y689 179 aa15.52■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 A6NNC1 897 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 HEXBP07686 556 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SP1P08047 785 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 MSNP26038 577 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CDKN2BP42772 138 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 PMPCAQ10713 525 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 WASHC5Q12768 1159 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SLC1A5Q15758 541 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 EMC4Q5J8M3 183 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 PLAG1Q6DJT9 500 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 FRMPD2BQ6IN97 320 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF449Q6P9G9 518 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 FIGLAQ6QHK4 219 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 MRGPRX2Q96LB1 330 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TEKT5Q96M29 485 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 COPS8Q99627 209 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 MENTQ9BUN1 341 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 VPS37BQ9H9H4 285 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 DMRT3Q9NQL9 472 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CRIM1Q9NZV1 1036 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TRPC4Q9UBN4 977 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 FAM153AQ9UHL3 310 aa15.51■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CFAP99D6REC4 459 aa15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.2 ms