RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053175.12

Vstm4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vstm4, Length 2,745 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Rbm11Q80YT9 238 aa20.2■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Ddx52Q8K301 598 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 HnrnplQ8R081 586 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 GhdcQ99J23 532 aa20.2■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Ubqln5Q9D4I8 510 aa20.2■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Tyk2Q9R117 1184 aa20.2■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Csf2rb2P26954 878 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Kcnj9P48543 393 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Entpd1P55772 510 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 CartptP56388 129 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Gpr143P70259 405 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Pan3Q640Q5 837 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Ca4Q64444 305 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Paqr3Q6TCG8 311 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Sdr16c5Q7TQA3 309 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Commd7Q8BG94 200 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Ldhal6bQ8BVP2 382 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Foxe1Q8R2I0 371 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Cdc16Q8R349 620 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Olfr791Q8VGJ0 312 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 NrarpQ91ZA8 114 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Mzt2Q9CQ25 159 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 CacybpQ9CXW3 229 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Pbdc1Q9D0B6 198 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Vnn3Q9QZ25 500 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Skp2Q9Z0Z3 424 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Gm5415E9PXF3 478 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Olfr414E9Q5P8 317 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Zfp788E9Q980 884 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Gm17093F6XGJ4 214 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Pdx1P52946 284 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Gabrr2P56476 465 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Fkbp14P59024 211 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Pitx1P70314 315 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Cab39Q06138 341 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Senp5Q6NXL6 749 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Tnpo3Q6P2B1 923 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 HadhaQ8BMS1 763 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Gprc6aQ8K4Z6 928 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Treml1Q8K558 317 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 FevQ8QZW2 237 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Cox18Q8VC74 331 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 KmoQ91WN4 479 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Ern1Q9EQY0 977 aa20.19■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Tgm7A2ART8 616 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Zfp964B2RR88 472 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Slc22a8O88909 537 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Odc1P00860 461 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 H2-D1P14427 368 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 PomkQ3TUA9 349 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Tmub2Q3V209 319 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Kpna1Q60960 538 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Sdf4Q61112 361 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Snta1Q61234 503 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Tpd52Q62393 224 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Sdc3Q64519 442 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Rapgefl1Q68EF8 662 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Gpalpp1Q69ZC8 346 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Ppm1fQ8CGA0 452 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Fam161aQ8QZV6 448 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 RbksQ8R1Q9 323 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Akr1d1Q8VCX1 325 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Glis2Q8VDL9 521 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Elp2Q91WG4 831 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Slc13a3Q91Y63 600 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Cyp4f3Q99N16 524 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Smg9Q9DB90 520 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Sacm1lQ9EP69 587 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 M1apQ9Z0E1 529 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Rgs6Q9Z2H2 472 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Nipsnap3aB1AWZ3 247 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Catsperg2C6KI89 1145 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Apol11bE9PUZ0 337 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Gm4450E9Q007 373 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Gm6811E9Q3Y8 510 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 P01810 119 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Zfp37P17141 594 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Csf2rbP26955 896 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Scgb1a1Q06318 96 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 CrtamQ149L7 389 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Ccdc177Q3UHB8 706 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Gm10696Q3UTC4 357 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 RasefQ5RI75 627 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Hsd3b4Q61767 373 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Fam149b1Q6NSV7 578 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Larp4Q8BWW4 719 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Abhd4Q8VD66 342 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Q922M7 232 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Orc6Q9WUJ8 262 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Cd300ld2A2A7W0 305 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Kpna6O35345 536 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 P06324 132 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Arpc4P59999 168 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Hoxd1Q01822 328 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 GiprQ0P543 460 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Cd163Q2VLH6 1121 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 Sez6l2Q4V9Z5 910 aa20.18■□□□□ 0.82
Vstm4-201ENSMUST00000053175 PtprnQ60673 979 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.7 ms