RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 CLCN5P51795 746 aa17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 CDKN2DP55273 166 aa17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 GPR68Q15743 365 aa17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 GPR19Q15760 415 aa17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 FAM72AQ5TYM5 149 aa17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 EEF1DP3Q658K8 133 aa17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 FAM72DQ6L9T8 149 aa17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 TFAP2EQ6VUC0 442 aa17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 FAM72BQ86X60 149 aa17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 ENTHD1Q8IYW4 607 aa17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 SH3RF2Q8TEC5 729 aa17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM209Q96SK2 561 aa17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 TBL1YQ9BQ87 522 aa17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 SHARPINQ9H0F6 387 aa17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 ALG5Q9Y673 324 aa17.16■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 ELOVL7A1L3X0 281 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 LACTBL1A8MY62 500 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 MYO1GB0I1T2 1018 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 RFPL3O75679 317 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 PAMP19021 973 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 SNX16P57768 344 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 PWP1Q13610 501 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 GNASQ5JWF2 1037 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 CDAN1Q8IWY9 1227 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 PGBD5Q8N414 524 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 CAMKK1Q8N5S9 505 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 OR8J3Q8NGG0 315 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 ENKURQ8TC29 256 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 FOXJ1Q92949 421 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 CD274Q9NZQ7 290 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 GMDSO60547 372 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 WDR47O94967 919 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 SERPINA1P01009 418 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 ITGB1P05556 798 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 FHP07954 510 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 RPL35P42766 123 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 NRIP1P48552 1158 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 ERVK-8P63133 956 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 FLYWCH1Q4VC44 716 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 CLLU1Q5K131 121 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 KCT2Q8NC54 265 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 OR2T11Q8NH01 316 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 IKZF5Q9H5V7 419 aa17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
GLIS1-202ENST00000628545 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 B4GALT5O43286 388 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 SH3BP5O60239 455 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 PTHP01270 115 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 HNF1BP35680 557 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 LTB4RQ15722 352 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 SLC14A2Q15849 920 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 DEFB106AQ8N104 65 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 GDPD1Q8N9F7 314 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 OR7G3Q8NG95 312 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 MYDGFQ969H8 173 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 TEPSINQ96N21 525 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 SAMD11Q96NU1 681 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 NUP205Q92621 2012 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 MYLKQ15746 1914 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00587B1AMM8 73 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 SYN3O14994 580 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 SCELO95171 688 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 F9P00740 461 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 RPP38P78345 283 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 RBP5P82980 135 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 MAB21L1Q13394 359 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 FBXO43Q4G163 708 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 GPR139Q6DWJ6 353 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC36Q8IYA8 594 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 RNF149Q8NC42 400 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 FAM149B1Q96BN6 582 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 PIP5K1AQ99755 562 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 FICDQ9BVA6 458 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 ELOVL6Q9H5J4 265 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 MAGIXQ9H6Y5 334 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 EMC3Q9P0I2 261 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 GABRQQ9UN88 632 aa17.14■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 GRXCR2A6NFK2 248 aa17.13■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 STX16O14662 325 aa17.13■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 MUSKO15146 869 aa17.13■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 STAU1O95793 577 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
GLIS1-202ENST00000628545 WDPCPO95876 746 aa17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms