RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 YIPF4Q9BSR8 244 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 RACGAP1Q9H0H5 632 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 EMX2Q04743 252 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R3AQ16821 1122 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR151Q8TDV0 419 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 COQ6Q9Y2Z9 468 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TMED5Q9Y3A6 229 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PLK4O00444 970 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ETV3P41162 512 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 KHKP50053 298 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 MERTKQ12866 999 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 DAG1Q14118 895 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PYDC2Q56P42 97 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM46DQ8NEK8 389 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 AP3S1Q92572 193 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 GBAP04062 536 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CD1DP15813 335 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 RTP4Q96DX8 246 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 FCRL4Q96PJ5 515 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 HAT1O14929 419 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 RFPL2O75678 378 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 STATHP02808 62 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 MYBPC1Q00872 1141 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 STEAP4Q687X5 459 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF347Q96SE7 839 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 LDB2O43679 373 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMD7P51665 324 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB30Q15771 203 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF805Q5CZA5 627 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 EXO5Q9H790 373 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 GRID2O43424 1007 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 H6PDO95479 791 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 RHDQ02161 417 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 MOGSQ13724 837 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 GANABQ14697 944 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SCD5Q86SK9 330 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PGRMC2O15173 223 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ALDH4A1P30038 563 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 IGFALSP35858 605 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PGDP52209 483 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 C6orf136Q5SQH8 315 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 OXR1Q8N573 874 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 AMBNQ9NP70 447 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 NDUFS4O43181 175 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF354BQ96LW1 612 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 IKZF2Q9UKS7 526 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.14■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 KMOO15229 486 aa20.14■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 FOXM1Q08050 763 aa20.14■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF846Q147U1 533 aa20.14■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TRPV3Q8NET8 790 aa20.14■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.14■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 MKS1Q9NXB0 559 aa20.14■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT33AO76009 404 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 DSTNP60981 165 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 RPS13P62277 151 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 24.5
PTPRJ-208ENST00000615445 HDDC2Q7Z4H3 204 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 SDHDO14521 159 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 AXIN1O15169 862 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 HCN1O60741 890 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 CLCN4P51793 760 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 DSC3Q14574 896 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 OR9A1PQ8NGU1 263 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC5A11Q8WWX8 675 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF382Q96SR6 550 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKHQ9HCJ1 492 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 SP140Q13342 867 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRJ-208ENST00000615445 DUOXA1Q1HG43 343 aa20.14■□□□□ 0.81
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