RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589753.1

ATG4D-211, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 931 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-211ENST00000589753 PCTPQ9UKL6 214 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 A0A0J9YY10 115 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 TLCD2A6NGC4 264 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 C9P02748 559 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 CDK4P11802 303 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 NEFHP12036 1026 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 SDHBP21912 280 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 CDH3P22223 829 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 NAGLUP54802 743 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 NAA20P61599 178 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 ABATP80404 500 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 UNC50Q53HI1 259 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 CFAP157Q5JU67 520 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 TRIM73Q86UV7 250 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 C17orf64Q86WR6 236 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 FAM20CQ8IXL6 584 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 OR4D9Q8NGE8 314 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 MOCOSQ96EN8 888 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 ACSS2Q9NR19 701 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 KLHL3Q9UH77 587 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 D6RAR5 112 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 CLGNO14967 610 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 KATNA1O75449 491 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 GNAZP19086 355 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 MPSTP25325 297 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 PLA2G5P39877 138 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 LSSP48449 732 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 ATP1A2P50993 1020 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 CLCQ05315 142 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 CARFQ8N187 725 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 NEIL2Q969S2 332 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 PPM1MQ96MI6 270 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 MAP3K3Q99759 626 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 RTKNQ9BST9 563 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 IPPKQ9H8X2 491 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 SH2B3Q9UQQ2 575 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 E7EQ34 232 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 RASSF9O75901 435 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 CDH1P12830 882 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 PVRP15151 417 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 EPORP19235 508 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 BGNP21810 368 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 HRH2P25021 359 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 GRIA3P42263 894 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 CDH13P55290 713 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 NAA25Q14CX7 972 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 CHI3L2Q15782 390 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 RBBP7Q16576 425 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 PRSS42Q7Z5A4 293 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 ATP6V1E2Q96A05 226 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 CNDP1Q96KN2 507 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 DPH7Q9BTV6 452 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 SEMA6CQ9H3T2 930 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 SLC6A20Q9NP91 592 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4D-211ENST00000589753 PDP2Q9P2J9 529 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms