RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	NTMT1	Q9BV86	223 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC32A1	Q9H598	525 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	OR1A2	Q9Y585	309 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318		H3BM21	787 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	GIPC1	O14908	333 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	UBD	O15205	165 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	CRCP	O75575	148 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SULT1C4	O75897	302 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	KRT34	O76011	436 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	INHBB	P09529	407 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	HTR6	P50406	440 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PPP2CB	P62714	309 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PPP2CA	P67775	309 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PTK2B	Q14289	1009 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	GRB7	Q14451	532 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	NFE2L1	Q14494	772 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PIGG	Q5H8A4	983 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	NEK5	Q6P3R8	708 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	DOK6	Q6PKX4	331 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318		Q7L0L9	218 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	HORMAD1	Q86X24	394 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	OR2T11	Q8NH01	316 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	STARD8	Q92502	1023 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	HLA-C	Q95604	372 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	FBXL8	Q96CD0	374 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	DYTN	A2CJ06	578 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	MGAT4D	A6NG13	374 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	KATNA1	O75449	491 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	EPB42	P16452	691 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ME2	P23368	584 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	IGFALS	P35858	605 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	BDKRB1	P46663	353 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TDG	Q13569	410 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	HERC3	Q15034	1050 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	EOGT	Q5NDL2	527 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PYCR2	Q96C36	320 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PHF12	Q96QT6	1004 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	WDR26	Q9H7D7	661 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		14.94	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	CHEK2	O96017	543 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	FUCA1	P04066	466 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ACADL	P28330	430 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PFN3	P60673	137 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SGCG	Q13326	291 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SQLE	Q14534	574 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318		Q6ZSR9	355 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SNX32	Q86XE0	403 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	OXR1	Q8N573	874 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	METTL6	Q8TCB7	284 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		14.93	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PRAMEF4	O60810	478 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	C1orf105	O95561	183 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		14.92	□□□□□ -0.02

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