RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588618.5

ACTN4-210, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTN4, Length 1,729 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-210ENST00000588618 YBX1P67809 324 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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ACTN4-210ENST00000588618 C17orf64Q86WR6 236 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 MID1IP1Q9NPA3 183 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 PARD6AQ9NPB6 346 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 RXFP3Q9NSD7 469 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 OR5K3A6NET4 321 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 CRCPO75575 148 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 PROS1P07225 676 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 NPPBP16860 134 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 MPSTP25325 297 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 PSMB5P28074 263 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 SH3BP2P78314 561 aa21.83■■□□□ 1.09
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ACTN4-210ENST00000588618 ZNF781Q8N8C0 355 aa21.83■■□□□ 1.09
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ACTN4-210ENST00000588618 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 EPB41L1Q9H4G0 881 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 ACTR8Q9H981 624 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 BTBD3Q9Y2F9 522 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTN4-210ENST00000588618 PROB1E7EW31 1015 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 PNLIPP16233 465 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 IRF8Q02556 426 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 TRAF3Q13114 568 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 DBX2Q6ZNG2 339 aa21.83■■□□□ 1.08
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ACTN4-210ENST00000588618 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 CUZD1Q86UP6 607 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 CRLF3Q8IUI8 442 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
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ACTN4-210ENST00000588618 SLC5A11Q8WWX8 675 aa21.83■■□□□ 1.08
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ACTN4-210ENST00000588618 CHMP6Q96FZ7 201 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 C7orf26Q96N11 449 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 CDK15Q96Q40 435 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF382Q96SR6 550 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 RABEP2Q9H5N1 569 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 SPHK1Q9NYA1 384 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 ACTR10Q9NZ32 417 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 DUX1O43812 170 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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ACTN4-210ENST00000588618 KIRREL3Q8IZU9 778 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 AGR3Q8TD06 166 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 RSC1A1Q92681 617 aa21.82■■□□□ 1.08
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ACTN4-210ENST00000588618 FTSJ1Q9UET6 329 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 C4orf47A7E2U8 309 aa21.81■■□□□ 1.08
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ACTN4-210ENST00000588618 OR2A1Q8NGT9 310 aa21.81■■□□□ 1.08
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ACTN4-210ENST00000588618 NR1D2Q14995 579 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 AMZ1Q400G9 498 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 SH2D4BQ5SQS7 431 aa21.8■■□□□ 1.08
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ACTN4-210ENST00000588618 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 ADCK2Q7Z695 626 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTN4-210ENST00000588618 NAXDQ8IW45 347 aa21.8■■□□□ 1.08
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