RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557673.5

NEK9-211, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 3

Gene NEK9, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-211ENST00000557673 BTN3A3O00478 584 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 BTN3A1O00481 513 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 KPNA5O15131 536 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 GPC4O75487 556 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 HBQ1P09105 142 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 FAM153BP0C7A2 387 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 CYP2A7P20853 494 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 CDH3P22223 829 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 NAB1Q13506 487 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 SLMAPQ14BN4 828 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 FAM153CQ494X1 144 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 SLC6A19Q695T7 634 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 OTOAQ7RTW8 1153 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 STRA8Q7Z7C7 330 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 RAB43Q86YS6 212 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 VRK3Q8IV63 474 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 OR5AR1Q8NGP9 310 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 ASZ1Q8WWH4 475 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 FAM136AQ96C01 138 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 NUDT9Q9BW91 350 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 MFRPQ9BY79 579 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 FUT8Q9BYC5 575 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 TXLNGYQ9BZA5 131 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 XKR8Q9H6D3 395 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 POMT2Q9UKY4 750 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 PADI2Q9Y2J8 665 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 V9GYY5 206 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 ITPR2Q14571 2701 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 C9J4A7 227 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 SLCO2B1O94956 709 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ACSL3O95573 720 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 IGHEP01854 428 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ALPPP05187 535 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 AGXTP21549 392 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ACADLP28330 430 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ATP5DP30049 168 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 PHBP35232 272 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 RORAP35398 523 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CLCN7P51798 805 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ITGA1P56199 1179 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 VSNL1P62760 191 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 SYTL1Q8IYJ3 562 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 IQCKQ8N0W5 287 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ZBTB2Q8N680 514 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 Q8NA96 180 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CD200R1Q8TD46 325 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 SLC30A3Q99726 388 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CPNE1Q99829 537 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 C17orf62Q9BQA9 187 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 DHRS4Q9BTZ2 278 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 RHOJQ9H4E5 214 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ACSS3Q9H6R3 686 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 GALPQ9UBC7 116 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ICKQ9UPZ9 632 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ASF1AQ9Y294 204 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 MED13Q9UHV7 2174 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 SHANK1Q9Y566 2161 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 TMEM150CB9EJG8 249 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 VPS26AO75436 327 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CD63P08962 238 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CHRM3P20309 590 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 GP5P40197 560 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CDKN2DP55273 166 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 FAM45BPQ6NSW5 357 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 AMIGO1Q86WK6 493 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CTAGE3PQ8IX95 158 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 PPM1NQ8N819 430 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 GPATCH11Q8N954 259 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 FAM45AQ8TCE6 357 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 VPS39Q96JC1 886 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 GPR21Q99679 349 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 RBBP8Q99708 897 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 PCMTD2Q9NV79 361 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 LUZP4Q9P127 313 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 KLHL42Q9P2K6 505 aa16■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 WIPF3A6NGB9 483 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ABHD2P08910 425 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 PVRP15151 417 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CD9P21926 228 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 FDXRP22570 491 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ABRQ12979 859 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms