RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555114.5

NEDD1-207, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 3

Gene NEDD1, Length 731 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-207ENST00000555114 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-207ENST00000555114 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-207ENST00000555114 CABS1Q96KC9 395 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-207ENST00000555114 MIPEPQ99797 713 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-207ENST00000555114 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-207ENST00000555114 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-207ENST00000555114 C14orf105Q9NVL8 296 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-207ENST00000555114 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-207ENST00000555114 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-207ENST00000555114 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-207ENST00000555114 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NEDD1-207ENST00000555114 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.77□□□□□ -0.04
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NEDD1-207ENST00000555114 PHF2O75151 1096 aa14.77□□□□□ -0.05
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NEDD1-207ENST00000555114 KLHL18O94889 574 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 C1orf105O95561 183 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 IFNB1P01574 187 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 SERPINA7P05543 415 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 EMP2P54851 167 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 EMP3P54852 163 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 Q0VFX4 171 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 ATG9BQ674R7 924 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 RNF44Q7L0R7 432 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 KRT222Q8N1A0 295 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 MPP5Q8N3R9 675 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 NR4A3Q92570 626 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 RELTQ969Z4 430 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 MVB12AQ96EY5 273 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 ABCA12Q86UK0 2595 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 CROCCQ5TZA2 2017 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 CELSR2Q9HCU4 2923 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 PFDN6O15212 129 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 NDUFS3O75489 264 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 BMP10O95393 424 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 ANXA5P08758 320 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 PRR35P0CG20 571 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 PSMB5P28074 263 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 BDKRB1P46663 353 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 TNFSF10P50591 281 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 RBPJQ06330 500 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 ART3Q13508 389 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 SEMA3AQ14563 771 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 GFRALQ6UXV0 394 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 MCEMP1Q8IX19 187 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 HAS2Q92819 552 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 C8orf44Q96CB5 159 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 ZNF778Q96MU6 729 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 LACRTQ9GZZ8 138 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 SVILO95425 2214 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 IDSB3KWA1 339 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 AP3B1O00203 1094 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 HEXBP07686 556 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 APRTP07741 180 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 COX6A1P12074 109 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 ICAM2P13598 275 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 SOX11P35716 441 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 KCNK10P57789 538 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 KIF5AQ12840 1032 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 DSG2Q14126 1118 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 VWA2Q5GFL6 755 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 PCID2Q5JVF3 399 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 TMEM207Q6UWW9 146 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 CCDC89Q8N998 374 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 CHST11Q9NPF2 352 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 RAB6BQ9NRW1 208 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 PAK5Q9P286 719 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD1-207ENST00000555114 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.74□□□□□ -0.05
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