RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	C1orf189	Q5VU69	101 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	C16orf46	Q6P387	395 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	CYS1	Q717R9	158 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	GPR135	Q8IZ08	494 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	MNS1	Q8NEH6	495 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC39A7	Q92504	469 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	ACTL8	Q9H568	366 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	PARVB	Q9HBI1	364 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	STARD5	Q9NSY2	213 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	KALRN	O60229	2985 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A0J9YVX5	310 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	OR2A25	A4D2G3	310 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	C21orf140	B9A014	251 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	CDC7	O00311	574 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	CREG1	O75629	220 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	GSTA2	P09210	222 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	ECHS1	P30084	290 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	GCGR	P47871	477 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	SP140	Q13342	867 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	ERV3-1	Q14264	604 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	ICE2	Q659A1	982 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	SBSN	Q6UWP8	590 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF44	Q7L0R7	432 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	EXD3	Q8N9H8	876 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	FBF1	Q8TES7	1133 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC138	Q96M89	665 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	GBP5	Q96PP8	586 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	CPNE1	Q99829	537 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	KCND3	Q9UK17	655 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	SPTA1	P02549	2419 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPCN1-223	ENST00000552985	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF839	A8K0R7	811 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC16A5	O15375	505 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	MED26	O95402	600 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	ITGB2	P05107	769 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	HBQ1	P09105	142 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM87A	P0C7U9	286 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	ITGAX	P20702	1163 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	PTPN4	P29074	926 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	GMPR	P36959	345 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	GP5	P40197	560 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	TBPL1	P62380	186 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	IL10RA	Q13651	578 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF425	Q6IV72	752 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	PAQR7	Q86WK9	346 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	PPM1N	Q8N819	430 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	IFT81	Q8WYA0	676 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	CDKL2	Q92772	493 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	WBP1	Q96G27	269 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TPCN1-223	ENST00000552985	GPR22	Q99680	433 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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