RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550261.5

PPP1CC-205, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 5

Gene PPP1CC, Length 747 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-205	ENST00000550261	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	CDK16	Q00536	496 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	OVGP1	Q12889	678 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	GAB1	Q13480	694 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	CSHL1	Q14406	222 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	PON2	Q15165	354 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ELF2	Q15723	593 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	P3H1	Q32P28	736 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	SRL	Q86TD4	932 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	OR2T3	Q8NH03	318 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	PIGK	Q92643	395 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	P3H4	Q92791	437 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	PMM1	Q92871	262 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	OLFM3	Q96PB7	478 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	SGK2	Q9HBY8	427 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	NEU3	Q9UQ49	428 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	CTAGE9	A4FU28	777 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM72C	H0Y354	149 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	SOCS2	O14508	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	PSMD3	O43242	534 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	PALM	O75781	387 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	PYGL	P06737	847 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ITGA5	P08648	1049 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	PRF1	P14222	555 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	GOT1	P17174	413 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	SLC8A1	P32418	973 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ACTN2	P35609	894 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	CPA2	P48052	419 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	FNTA	P49354	379 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	AGTR2	P50052	363 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF84	P51523	738 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	PDE1B	Q01064	536 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	CBFB	Q13951	182 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF234	Q14588	700 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	DLG2	Q15700	870 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	CCNG2	Q16589	344 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ALF	Q53S48	1182 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	MARC1	Q5VT66	337 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		4.16	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms