RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548159.5

CNOT2-209, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CNOT2, Length 2,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2-209ENST00000548159 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.61■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 SMYD1Q8NB12 490 aa15.61■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 RAB2BQ8WUD1 216 aa15.61■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 TESCQ96BS2 214 aa15.61■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 CMTM7Q96FZ5 175 aa15.61■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 FRG2BQ96QU4 278 aa15.61■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 C19orf43Q9BQ61 176 aa15.61■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 CREBZFQ9NS37 354 aa15.61■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 BAG5Q9UL15 447 aa15.61■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 CCL26Q9Y258 94 aa15.61■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 BTBD3Q9Y2F9 522 aa15.61■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 MICAL3Q7RTP6 2002 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 MYO1GB0I1T2 1018 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 URODP06132 367 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 ENGP17813 658 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 PCMT1P22061 227 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 FMO3P31513 532 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 KIR3DL1P43629 444 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 SPINT3P49223 89 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 DAPP51397 102 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 PFN3P60673 137 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 EPS8Q12929 822 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 TUBA3CQ13748 450 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 GBX1Q14549 363 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 UGT8Q16880 541 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 C22orf39Q6P5X5 142 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 ZNF621Q6ZSS3 439 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 Q6ZVU0 165 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 L3MBTL4Q8NA19 623 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 BORCS5Q969J3 196 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 VWCEQ96DN2 955 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 NRBF2Q96F24 287 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 HHIPQ96QV1 700 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 PANX1Q96RD7 426 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 NODALQ96S42 347 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 OR2AG2A6NM03 316 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 CLIC1O00299 241 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 BCKDKO14874 412 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 SLC16A6O15403 523 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 NUAK1O60285 661 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 SCN2BO60939 215 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 KCNK5O95279 499 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 MAGEA2P43356 314 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 WNT3P56703 355 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 VLDLRP98155 873 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 MOGQ16653 247 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 GGTA1PQ4G0N0 100 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 CRTC3Q6UUV7 619 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 LMLNQ96KR4 655 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 ZNF558Q96NG5 402 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 RIBC2Q9H4K1 309 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 TBC1D23Q9NUY8 699 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 COL4A6Q14031 1691 aa15.6■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 GFYI3L273 518 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 FPGTO14772 594 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 IGFBP5P24593 272 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 NOGQ13253 232 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 HIPK1Q86Z02 1210 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 PARP8Q8N3A8 854 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 UBE2FQ969M7 185 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 MUL1Q969V5 352 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 DNAJC11Q9NVH1 559 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 FAIMQ9NVQ4 179 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 PPIL1Q9Y3C6 166 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 LEFTY2O00292 366 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 SGTAO43765 313 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 C8GP07360 202 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.096e-6■■■□□ 18.4
CNOT2-209ENST00000548159 CLK3P49761 638 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 CCSMST1Q4G0I0 132 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 TMEM25Q86YD3 366 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 SYT12Q8IV01 421 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 CPXM2Q8N436 756 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 PIK3C3Q8NEB9 887 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 LZICQ8WZA0 190 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 SLC46A2Q9BY10 475 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 IL1RAPQ9NPH3 570 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 ERVK-18Q9QC07 812 aa15.59■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 CHD7Q9P2D1 2997 aa15.58■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 ARHGEF15O94989 841 aa15.58■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 CCNDBP1O95273 360 aa15.58■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 NUDT7P0C024 238 aa15.58■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 PRPH2P23942 346 aa15.58■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 CD6P30203 668 aa15.58■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 MAP2K4P45985 399 aa15.58■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 RAD23AP54725 363 aa15.58■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 ABRQ12979 859 aa15.58■□□□□ 0.09
CNOT2-209ENST00000548159 CDKL4Q5MAI5 379 aa15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms