RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 CD84Q9UIB8 345 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 CDH22Q9UJ99 828 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 PCTPQ9UKL6 214 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 VPS4AQ9UN37 437 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 PSMD13Q9UNM6 376 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 OARD1Q9Y530 152 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 MAU2Q9Y6X3 613 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 COL4A3Q01955 1670 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 PLXNA2O75051 1894 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 A0A087WXM4 84 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 H3BNH8 94 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 CCRL2O00421 344 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 E2F3O00716 465 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 RAD51BO15315 384 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 FFAR2O15552 330 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 ASNA1O43681 348 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 KRT34O76011 436 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 PRNPP04156 253 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 CAPN1P07384 714 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 OR56A5P0C7T3 313 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 PSMC3P17980 439 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 MMP12P39900 470 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 FOXA1P55317 472 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 SLC25A3Q00325 362 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 PPP1R3AQ16821 1122 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 GRAMD1BQ3KR37 738 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 UGT3A2Q3SY77 523 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 POM121L1PQ3SYA9 428 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 FBXO43Q4G163 708 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 KANK2Q63ZY3 851 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 LPCAT4Q643R3 524 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 TANGO2Q6ICL3 276 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 VITQ6UXI7 678 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 AMIGO2Q86SJ2 522 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 CPA6Q8N4T0 437 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 FBXL6Q8N531 539 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 TRAM1L1Q8N609 369 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 OR56A4Q8NGH8 313 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 TWIST2Q8WVJ9 160 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 S100ZQ8WXG8 99 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 MARK4Q96L34 752 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 OPALINQ96PE5 141 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 THTPAQ9BU02 230 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 ACAT2Q9BWD1 397 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 ABCG8Q9H221 673 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 FAM83DQ9H4H8 585 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 SLC28A3Q9HAS3 691 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 ZFP14Q9HCL3 533 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 HMG20AQ9NP66 347 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 KCTD5Q9NXV2 234 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa7.57□□□□□ -1.2
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CS-204ENST00000546621 A0A1B0GTL3 188 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 CLDN25C9JDP6 229 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 H3BMQ9 156 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 RFXAPO00287 272 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 GIPC1O14908 333 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 PIP5K1BO14986 540 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 UBDO15205 165 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 LINC01565O15544 149 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 CRCPO75575 148 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 ELFN1P0C7U0 828 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 HLA-EP13747 358 aa7.57□□□□□ -1.2
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