RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 MGARPQ8TDB4 240 aa24.79■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 OR2A14Q96R47 310 aa24.79■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 TRMOQ9BU70 441 aa24.79■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 C1GALT1Q9NS00 363 aa24.79■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 SPHK1Q9NYA1 384 aa24.79■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 A0A0J9YY10 115 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 A0A1W2PQM1 296 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 TLCD2A6NGC4 264 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 E2F3O00716 465 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 GDF5P43026 501 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 NKAIN2Q5VXU1 208 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 TEX9Q8N6V9 391 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 SNX31Q8N9S9 440 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 OR2L3Q8NG85 312 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 OR4D9Q8NGE8 314 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 FAM76AQ8TAV0 307 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 ZUFSPQ96AP4 578 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 ESAMQ96AP7 390 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 CNDP1Q96KN2 507 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 TMEM237Q96Q45 408 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 RTKNQ9BST9 563 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 PCTPQ9UKL6 214 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa24.78■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 MAP3K7O43318 606 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 MLYCDO95822 493 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 CHN1P15882 459 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 CDH3P22223 829 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 GRK2P25098 689 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 NAGLUP54802 743 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 PCDH1Q08174 1060 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 UNC50Q53HI1 259 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 USP53Q70EK8 1073 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 CCNYL1Q8N7R7 359 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 DYDC1Q8WWB3 177 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 SLC5A11Q8WWX8 675 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 NRTNQ99748 197 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 ACAT2Q9BWD1 397 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 EHD1Q9H4M9 534 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 ABCF3Q9NUQ8 709 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 SNX7Q9UNH6 387 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 KLK4Q9Y5K2 254 aa24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
STIP1-208ENST00000540501 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 GIPC1O14908 333 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 NPHS1O60500 1241 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 UGDHO60701 494 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 CLCQ05315 142 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 FBXO48Q5FWF7 155 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 KMT5CQ86Y97 462 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 ATP6V1E2Q96A05 226 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 TGM7Q96PF1 710 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 OR4K3Q96R72 315 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 MECRQ9BV79 373 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 PITPNM3Q9BZ71 974 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 SEMA6CQ9H3T2 930 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 PELI2Q9HAT8 420 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 TMEM184CQ9NVA4 438 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 PDP2Q9P2J9 529 aa24.76■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 CEP250Q9BV73 2442 aa24.75■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 SERPINE1P05121 402 aa24.75■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 CXCR2P25025 360 aa24.75■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 ATG16L1Q676U5 607 aa24.75■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 PRSS42Q7Z5A4 293 aa24.75■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa24.75■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 MDM1Q8TC05 714 aa24.75■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 TMEM74Q96NL1 305 aa24.75■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 NTMT1Q9BV86 223 aa24.75■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 IPPKQ9H8X2 491 aa24.75■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 MLXIPLQ9NP71 852 aa24.75■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 SEMA5BQ9P283 1151 aa24.75■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 WDR91A4D1P6 747 aa24.74■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 TMEM114B3SHH9 223 aa24.74■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 D6RAR5 112 aa24.74■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 OTCP00480 354 aa24.74■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 PSMB5P28074 263 aa24.74■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 CSF2RBP32927 897 aa24.74■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 GRK3P35626 688 aa24.74■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 CCNG1P51959 295 aa24.74■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 RELAQ04206 551 aa24.74■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 LAPTM5Q13571 262 aa24.74■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 TBCCQ15814 346 aa24.74■■□□□ 1.55
STIP1-208ENST00000540501 CACHD1Q5VU97 1274 aa24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms