RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533870.1

SOX6-217, Transcript of SRY-box 6, humanhuman

TSL 5

Gene SOX6, Length 7,224 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6-217ENST00000533870 GPR21Q99679 349 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 APOL5Q9BWW9 433 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 CRTAC1Q9NQ79 661 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 TAS2R8Q9NYW2 309 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 HSPB11Q9Y547 144 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 AP3D1O14617 1153 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 OR4F21O95013 312 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 PGLSO95336 258 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 AK1P00568 194 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 STOMP27105 288 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 PCSK6P29122 969 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 IDUAP35475 653 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 CDH8P55286 799 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 OR4D2P58180 307 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 COL28A1Q2UY09 1125 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 KCTD11Q693B1 232 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 STX12Q86Y82 276 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 EPHX4Q8IUS5 362 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 DENND6AQ8IWF6 608 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 KLHL36Q8N4N3 616 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 ARRDC4Q8NCT1 418 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 TTLQ8NG68 377 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 OR7G3Q8NG95 312 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 OR4F6Q8NGB9 312 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 PPTC7Q8NI37 304 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 ATOH8Q96SQ7 321 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 EPYCQ99645 322 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 GSTO2Q9H4Y5 243 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 ACSS2Q9NR19 701 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 MAFFQ9ULX9 164 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 GPR45Q9Y5Y3 372 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 ANKRD61A6NGH8 418 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 KCNQ2O43526 872 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 TSPAN1O60635 241 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 OAZ2O95190 189 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 ATE1O95260 518 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 C1QBP02746 253 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 BMP7P18075 431 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 OPRL1P41146 370 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 SOX9P48436 509 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 SEPHS1P49903 392 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 FCGRTP55899 365 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 SREBF2Q12772 1141 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 MED22Q15528 200 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 PKDCCQ504Y2 493 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 USP30Q70CQ3 517 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 CBLL1Q75N03 491 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 OR10A6Q8NH74 314 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 LINGO1Q96FE5 620 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 FBXL20Q96IG2 436 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 LRFN5Q96NI6 719 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 DOHHQ9BU89 302 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 MED18Q9BUE0 208 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 FNDC11Q9BVV2 318 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 ASPNQ9BXN1 380 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 POTEKPQ9BYX7 375 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 SLC39A1Q9NY26 324 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 EBF1Q9UH73 591 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 LIPT1Q9Y234 373 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 ENPP4Q9Y6X5 453 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 C1QAP02745 245 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 IL3P08700 152 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 INHBBP09529 407 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 GGT2P36268 569 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 DCDC1P59894 354 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 BCL2L1Q07817 233 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 CDK5R2Q13319 367 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 SPHARQ15513 63 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 C10orf120Q5SQS8 335 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 FAM69AQ5T7M9 428 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 FRG2Q64ET8 278 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 USP45Q70EL2 814 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 ISCA2Q86U28 154 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 TMEM192Q8IY95 271 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 SLC34A3Q8N130 599 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 FBXO27Q8NI29 283 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 TCEAL4Q96EI5 215 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 SLC39A13Q96H72 371 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 HSH2DQ96JZ2 352 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 APOLD1Q96LR9 279 aa3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SOX6-217ENST00000533870 FRG2BQ96QU4 278 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms