RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	TNNT1	P13805	278 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	NR2C2	P49116	596 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	TYRO3	Q06418	890 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	FIGN	Q5HY92	759 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	KAZN	Q674X7	775 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	RPRML	Q8N4K4	120 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	SCMH1	Q96GD3	660 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	GBA3	Q9H227	469 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	PPT2	Q9UMR5	302 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	FOXS1	O43638	330 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	OR1I1	O60431	355 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	TPH1	P17752	444 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	CXCR2	P25025	360 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	PSMB4	P28070	264 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	RBL1	P28749	1068 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	CCR7	P32248	378 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	LTB	Q06643	244 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	STX1A	Q16623	288 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	ACER2	Q5QJU3	275 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	H2AFV	Q71UI9	128 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF358	Q9NW07	568 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0U1RQJ8	604 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1W2PPV9	198 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557		H7C0S8	307 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	TTI1	O43156	1089 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	AP2A2	O94973	939 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	CRTAM	O95727	393 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	S1PR4	O95977	384 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	HEXB	P07686	556 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	ABO	P16442	354 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	PTGER1	P34995	402 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	SLC26A3	P40879	764 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	GEM	P55040	296 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	DSG2	Q14126	1118 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	OR1C1	Q15619	314 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	CEBPE	Q15744	281 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC38	Q5VT99	294 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	HDAC10	Q969S8	669 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	VAT1	Q99536	393 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	MIPEP	Q99797	713 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	RNF6	Q9Y252	685 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	IQCF5	A8MTL0	148 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557	TARM1	B6A8C7	271 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BBS1-222	ENST00000533557		H0YGG7	62 aa		11.48	□□□□□ -0.57

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