RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 EMP2P54851 167 aa15.35■□□□□ 0.05
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PTPRU-210ENST00000527027 TMEM207Q6UWW9 146 aa15.35■□□□□ 0.05
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PTPRU-210ENST00000527027 CSMD2Q7Z408 3487 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-210ENST00000527027 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa15.32■□□□□ 0.04
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PTPRU-210ENST00000527027 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 27.9
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PTPRU-210ENST00000527027 HTR1EP28566 365 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-210ENST00000527027 FDFT1P37268 417 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-210ENST00000527027 BDKRB1P46663 353 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-210ENST00000527027 TTPAP49638 278 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-210ENST00000527027 DSG2Q14126 1118 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-210ENST00000527027 NAA25Q14CX7 972 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
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