RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 PSMD9O00233 223 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 BUB1O43683 1085 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 GCATO75600 419 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TPM2P07951 284 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 HGFP14210 728 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 GPD1P21695 349 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 DRD4P21917 467 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 BMP5P22003 454 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 KELP23276 732 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 EPHB2P29323 1055 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 STAT1P42224 750 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TIRAPP58753 221 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 KIAA1024LP59773 190 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 RHOAP61586 193 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 BTKQ06187 659 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 PTP4A2Q12974 167 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 KCNAB1Q14722 419 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 UGP2Q16851 508 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CDO1Q16878 200 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 C2CD6Q53TS8 623 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 Q6ZWC4 215 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 MON1BQ7L1V2 547 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 VPS36Q86VN1 386 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 FAM72BQ86X60 149 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 GKN2Q86XP6 184 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 RBFAQ8N0V3 343 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC185Q8N715 623 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 OR6K2Q8NGY2 324 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 GPT2Q8TD30 523 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 LRRC46Q96FV0 321 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CNPY3Q9BT09 278 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CLPBQ9H078 707 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 APPL1Q9UKG1 709 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 COL12A1Q99715 3063 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 A0A1W2PQ67 120 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 H0YIZ8 118 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 M0R3H8 397 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 QSOX1O00391 747 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 PES1O00541 588 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 NVLO15381 856 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 PRAMEF11O60813 436 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 GFPT2O94808 682 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 NUDT3O95989 172 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CHRNB2P17787 502 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 NFKBIAP25963 317 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CD82P27701 267 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 SERPINA4P29622 427 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 GKP32189 559 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 NDST2P52849 883 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 IRF4Q15306 451 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 ALG11Q2TAA5 492 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 FAXCQ5TGI0 409 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 ECHDC3Q96DC8 303 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 HMCESQ96FZ2 354 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 KLK15Q9H2R5 256 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 LRRC19Q9H756 370 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 PDFQ9HBH1 243 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 LHX3Q9UBR4 397 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 KLQ9UEF7 1012 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 FZD10Q9ULW2 581 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 ZW10O43264 779 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 SNX2O60749 519 aa6.72□□□□□ -1.33
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