RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HYKKA2RU49 373 aa16.1■□□□□ 0.17
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 VPS26AO75436 327 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC16A8O95907 504 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITGAXP20702 1163 aa16.1■□□□□ 0.17
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 MPP1Q00013 466 aa16.09■□□□□ 0.17
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 MORF4L2Q15014 288 aa16.09■□□□□ 0.17
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIAA0408Q6ZU52 694 aa16.09■□□□□ 0.17
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF14Q9UBS8 474 aa16.09■□□□□ 0.17
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A6NL46 340 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC188H7C350 402 aa16.08■□□□□ 0.16
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERVK-10P10266 1014 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MMP11P24347 488 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD97P48960 835 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DR1Q01658 176 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGFBP7Q16270 282 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRTGQ2VWP7 1150 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ICE2Q659A1 982 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF425Q6IV72 752 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAQR7Q86WK9 346 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR4N4Q8N0Y3 316 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MIB2Q96AX9 1013 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC39Q96DD0 335 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF304Q9HCX3 659 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VSTM2BA6NLU5 285 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H0YGG7 62 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYF2O95926 243 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AHSGP02765 367 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HRH2P25021 359 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GABRB3P28472 473 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAFAH1B1P43034 410 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RGS4P49798 205 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MUM1Q2TAK8 710 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BBS9Q3SYG4 887 aa16.07■□□□□ 0.16
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