RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495188.2

RNF146-208, Transcript of ring finger protein 146, human

TSL 2

Gene RNF146, Length 593 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF146-208	ENST00000495188	UBE2C	O00762	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	SEC24A	O95486	1093 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	CSN3	P07498	182 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	EPCAM	P16422	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	KRT20	P35900	424 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	VAMP7	P51809	220 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	NUCB1	Q02818	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	NPTX1	Q15818	432 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	KYNU	Q16719	465 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	HLA-B	Q31612	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	MOCOS	Q96EN8	888 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188		H7C423	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	GGPS1	O95749	300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	CLDN1	O95832	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	DNTT	P04053	509 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	ACHE	P22303	614 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	VTN	P04004	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	GP1BB	P13224	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	KRT5	P13647	590 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	LHCGR	P22888	699 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	LBX1	P52954	281 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	PPP5C	P53041	499 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	E2F5	Q15329	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF613	Q6PF04	617 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	RMDN1	Q96DB5	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188		R4GN57	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188		A0A1W2PPK0	400 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	AP5Z1	O43299	807 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	SNX3	O60493	162 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	MMP12	P39900	470 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	OPRL1	P41146	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	MYL7	Q01449	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	DRP2	Q13474	957 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF74	Q16587	644 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	MAPK15	Q8TD08	544 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	PROX1	Q92786	737 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	URAD	A6NGE7	173 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF146-208	ENST00000495188	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.7 ms