RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 NFS1Q9Y697 457 aa13.58□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 DUSP10Q9Y6W6 482 aa13.58□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 A0A0J9YVX5 310 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 CCL21O00585 134 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 FFAR3O14843 346 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 GPR42O15529 346 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 BMP10O95393 424 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 ITGAMP11215 1152 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 CTNNA2P26232 953 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 KIR3DL1P43629 444 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 PCOLCEQ15113 449 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 INAQ16352 499 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 SYTL3Q4VX76 610 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 CCDC181Q5TID7 509 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 RNF44Q7L0R7 432 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 KRT222Q8N1A0 295 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 AMER3Q8N944 861 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 ACBD4Q8NC06 268 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 OR2L3Q8NG85 312 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 OR52K1Q8NGK4 314 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 ASZ1Q8WWH4 475 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 IMMP1LQ96LU5 166 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 RUBCNLQ9H714 662 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa13.57□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 SCN2AQ99250 2005 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 AKAP6Q13023 2319 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 MACROD2A1Z1Q3 448 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 OR2A25A4D2G3 310 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 IDSB3KWA1 339 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 MAP2K7O14733 419 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 KDM1AO60341 852 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 STK10O94804 968 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 FKBP9O95302 570 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 C1orf105O95561 183 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC26A3P40879 764 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 EMP2P54851 167 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 OCA2Q04671 838 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 PRMT9Q6P2P2 845 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM205Q6UW68 189 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM207Q6UWW9 146 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 TC2NQ8N9U0 490 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 DNAJB8Q8NHS0 232 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC35B2Q8TB61 432 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 MIPEPQ99797 713 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 FERMT1Q9BQL6 677 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 RNF32Q9H0A6 362 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 CHST11Q9NPF2 352 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 RIMKLBQ9ULI2 386 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF835Q9Y2P0 537 aa13.56□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 DYTNA2CJ06 578 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 H0YGG7 62 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 FOXS1O43638 330 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 TPM3P06753 285 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 FDXRP22570 491 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 PMP22Q01453 160 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 C3AR1Q16581 482 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 TSTD2Q5T7W7 516 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 RPTNQ6XPR3 784 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 LRRC57Q8N9N7 239 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 OR4L1Q8NH43 312 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 VPS50Q96JG6 964 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 TGIF2Q9GZN2 237 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF700Q9H0M5 742 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 P2RY12Q9H244 342 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 SEC14L3Q9UDX4 400 aa13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 A0A0U1RQJ8 604 aa13.54□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 CBFA2T2O43439 604 aa13.54□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 SUN1O94901 812 aa13.54□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 TJP3O95049 919 aa13.54□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 RASAL1O95294 804 aa13.54□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 BDKRB1P46663 353 aa13.54□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 EMP3P54852 163 aa13.54□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 RWDD2BP57060 319 aa13.54□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 DSG2Q14126 1118 aa13.54□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 SYT16Q17RD7 645 aa13.54□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 MUM1Q2TAK8 710 aa13.54□□□□□ -0.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 HKDC1Q2TB90 917 aa13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms