RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464029.5

SYPL1-204, Transcript of synaptophysin like 1, humanhuman

TSL 2

Gene SYPL1, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1-204ENST00000464029 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 HPS4Q9NQG7 708 aa5.96□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.96□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CHST12Q9NRB3 414 aa5.96□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CHRAC1Q9NRG0 131 aa5.96□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 DDIT4Q9NX09 232 aa5.96□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 OSER1Q9NX31 292 aa5.96□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.96□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 SUN2Q9UH99 717 aa5.96□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 ANAPC2Q9UJX6 822 aa5.96□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CLCA2Q9UQC9 943 aa5.96□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 ZNF510Q9Y2H8 683 aa5.96□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa5.96□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CITO14578 2027 aa5.96□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 PLXNB2O15031 1838 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 A0A0J9YYE9 177 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 A0A1W2PP18 115 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 A8MT66 165 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 E7ENX8 843 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 H3BSA7 217 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 KCNK1O00180 336 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CLOCKO15516 846 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 EEDO75530 441 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 SOAT2O75908 522 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 ARIH2O95376 493 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 IGLV3-25P01717 112 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 PYGLP06737 847 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 SBK3P0C264 359 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 ETS2P15036 469 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 HLA-DPA1P20036 260 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CCNA2P20248 432 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 MSH3P20585 1137 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 XPAP23025 273 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CCR1P32246 355 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 RFC2P35250 354 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 SLC1A2P43004 574 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 RPS9P46781 194 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 RXRGP48443 463 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CCT8P50990 548 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 PKNOX1P55347 436 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 KCNK10P57789 538 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CSNK2BP67870 215 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CRADDP78560 199 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 OCA2Q04671 838 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 ACVR1Q04771 509 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 LCP2Q13094 533 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 RPS6KA2Q15349 733 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CYTH1Q15438 398 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CCL14Q16627 93 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 FAM110CQ1W6H9 321 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 LRRC26Q2I0M4 334 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 DUSP28Q4G0W2 176 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 ZNF678Q5SXM1 525 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 TSTD2Q5T7W7 516 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 AFMIDQ63HM1 303 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 ZNF470Q6ECI4 717 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 ZNF773Q6PK81 442 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CLEC20AQ6ZU45 233 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 TAS1R1Q7RTX1 841 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 AMIGO2Q86SJ2 522 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 TDHQ8IZJ6 230 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 GALNT4Q8N4A0 578 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CARNMT1Q8N4J0 409 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 FAM47BQ8NA70 645 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 STAG3L4Q8TBR4 150 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CHPT1Q8WUD6 406 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 KCTD4Q8WVF5 259 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 LRTOMTQ8WZ04 291 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 NELL1Q92832 810 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CPB2Q96IY4 423 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 MARK4Q96L34 752 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CEP295NLQ96MC4 621 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 UROC1Q96N76 676 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CCDC115Q96NT0 180 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 ACBD6Q9BR61 282 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 C16orf70Q9BSU1 422 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 MED10Q9BTT4 135 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 UGT2B28Q9BY64 529 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 CXorf21Q9HAI6 301 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 TXNRD2Q9NNW7 524 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 HMG20AQ9NP66 347 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 ABCC13Q9NSE7 274 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 PIGVQ9NUD9 493 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 ATAD3AQ9NVI7 634 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 HSFX1Q9UBD0 423 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 RNF11Q9Y3C5 154 aa5.95□□□□□ -1.46
SYPL1-204ENST00000464029 Q9Y3F1 56 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms