RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463369.5

SHQ1-203, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SHQ1, Length 2,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-203ENST00000463369 FAM83EQ2M2I3 478 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 YIF1BQ5BJH7 314 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 RABL3Q5HYI8 236 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ACOT1Q86TX2 421 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 METTL23Q86XA0 190 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 MIER2Q8N344 545 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 DNAJB14Q8TBM8 379 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 HEXDCQ8WVB3 486 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 RAD9AQ99638 391 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 DPEP3Q9H4B8 488 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 SMURF2Q9HAU4 748 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 TM9SF3Q9HD45 589 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 SLC52A3Q9NQ40 469 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 GIMAP4Q9NUV9 329 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 V9GYQ6 96 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 DENND4CQ5VZ89 1909 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 BPTFQ12830 3046 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 MYO9BQ13459 2157 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 PLXNA3P51805 1871 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 METTL15A6NJ78 407 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 HCRTO43612 131 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 MFSD11O43934 449 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 TULP3O75386 442 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 SLC22A3O75751 556 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 CNTN5O94779 1100 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 OAZ2O95190 189 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 MATN4O95460 622 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 APOA1P02647 267 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 LAG3P18627 525 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 KCNA5P22460 613 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 NMBRP28336 390 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 HTR1EP28566 365 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 RYKP34925 604 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 PBX3P40426 434 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 MAP2K4P45985 399 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 OR3A3P47888 321 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 RGS7P49802 495 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 DEFA1P59665 94 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 DEFA3P59666 94 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 FADDQ13158 208 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 KCNAB2Q13303 367 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 CDK5R2Q13319 367 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 CLCA4Q14CN2 919 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF691Q5VV52 312 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF470Q6ECI4 717 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 CLEC6AQ6EIG7 209 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 FUT10Q6P4F1 479 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 MFSD6LQ8IWD5 586 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 KRT78Q8N1N4 520 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 CADM2Q8N3J6 435 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 CCDC185Q8N715 623 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 C12orf29Q8N999 325 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 NETO2Q8NC67 525 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 CCNYQ8ND76 341 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 Q8NFD4 153 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 MCOLN3Q8TDD5 553 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 C19orf60Q96EN9 201 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 CHFRQ96EP1 664 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 IGSF21Q96ID5 467 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ACBD6Q9BR61 282 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 TTPALQ9BTX7 342 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ADAM19Q9H013 955 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 PLSCR3Q9NRY6 295 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 KRT84Q9NSB2 600 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 SLC13A4Q9UKG4 626 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 CDH9Q9ULB4 789 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 A0A087X1B8 175 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms