RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	DEFB118	Q96PH6	123 aa		16.44	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		16.44	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	16.44	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		16.44	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	PRMT3	O60678	531 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	SCN2B	O60939	215 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	LRG1	P02750	347 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	RYK	P34925	604 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	HAL	P42357	657 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	DEFB103A	P81534	67 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	WASH3P	C4AMC7	463 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	UGDH	O60701	494 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	MTX2	O75431	263 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	ITGAM	P11215	1152 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	CD22	P20273	847 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	AGXT	P21549	392 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	RAD23A	P54725	363 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	WNT3	P56703	355 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	CREM	Q03060	361 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	SPIDR	Q14159	915 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	LIPJ	Q5W064	366 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058		Q6ZVU0	165 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM25	Q86YD3	366 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	RNF175	Q8N4F7	328 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		16.43	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	EVPLL	A8MZ36	301 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	SLCO2B1	O94956	709 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	C1QC	P02747	245 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF30	P17039	623 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	PLA2G16	P53816	162 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	ABR	Q12979	859 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	KCNC3	Q14003	757 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	UGT8	Q16880	541 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	TRIM60	Q495X7	471 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	LILRA6	Q6PI73	481 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	EBPL	Q9BY08	206 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	CCL26	Q9Y258	94 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058		U3KQV3	271 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	CARNS1	A5YM72	827 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	CLIC1	O00299	241 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	SLC1A7	O00341	560 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	AP2A2	O94973	939 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	SEMG1	P04279	462 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	GPX2	P18283	190 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	C21orf58	P58505	322 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	DCDC1	P59894	354 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	SYT12	Q8IV01	421 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	ELMO1	Q92556	727 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	SCAMP4	Q969E2	229 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	TOX2	Q96NM4	488 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	CSF3R	Q99062	836 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	ZBP1	Q9H171	429 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	TBX21	Q9UL17	535 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		16.42	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	CFAP99	D6REC4	459 aa		16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	FPGT	O14772	594 aa		16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	FKTN	O75072	461 aa		16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	KCNK5	O95279	499 aa		16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	GSTM1	P09488	218 aa		16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	VIPR1	P32241	457 aa		16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	RANBP1	P43487	201 aa		16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	IRF8	Q02556	426 aa		16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	GSTM4	Q03013	218 aa		16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	BNIP3	Q12983	259 aa		16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	VMAC	Q2NL98	169 aa		16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	MUL1	Q969V5	352 aa		16.41	■□□□□ 0.22
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF566	Q969W8	418 aa		16.41	■□□□□ 0.22

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