RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 RAD51DO75771 328 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 DIRAS3O95661 229 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 FGF2P09038 288 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 SKILP12757 684 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 MYOD1P15172 320 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 AREGP15514 252 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 CBLP22681 906 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCKBRP32239 447 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 IER3P46695 156 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 INAQ16352 499 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCDC40Q4G0X9 1142 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 MANEAQ5SRI9 462 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 PM20D1Q6GTS8 502 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 MACC1Q6ZN28 852 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 EXOC3L1Q86VI1 746 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANKRD46Q86W74 232 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 AMIGO1Q86WK6 493 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 PTOV1Q86YD1 416 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM126BQ8IUX1 230 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 ODF3L1Q8IXM7 274 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 MMD2Q8IY49 270 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 CRYBG2Q8N1P7 616 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 L3MBTL4Q8NA19 623 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR13J1Q8NGT2 312 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 FGFBP3Q8TAT2 258 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 RNF128Q8TEB7 428 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 CKAP2Q8WWK9 683 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 P2RX5Q93086 422 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 PHF21AQ96BD5 680 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 DHX58Q96C10 678 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 CTAGE1Q96RT6 745 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 KCNK16Q96T55 309 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 TM6SF1Q9BZW5 370 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 VN1R1Q9GZP7 353 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 Q9H8V8 135 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRPC7Q9HCX4 862 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 POLE3Q9NRF9 147 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 GKN1Q9NS71 199 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 NDUFA13Q9P0J0 144 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 IL36RNQ9UBH0 155 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF580Q9UK33 172 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 KCNS2Q9ULS6 477 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 NPHP3Q7Z494 1330 aa3.89□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 LINC01553A4QN01 128 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 CASTOR2A6NHX0 329 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 INAFM1C9JVW0 142 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 RASGRF2O14827 1237 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 LDLRP01130 860 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 C9P02748 559 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 SP9P0CG40 484 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 PSG1P11464 419 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 IRF2P14316 349 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 CKMT2P17540 419 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 S1PR1P21453 382 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 SSTR1P30872 391 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 CLDN15P56746 228 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 BRWD1-AS2P59051 145 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRKCEQ02156 737 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 DSC1Q08554 894 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPS2Q13227 327 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 GAMTQ14353 236 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRTGQ2VWP7 1150 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 EPC2Q52LR7 807 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 NEK5Q6P3R8 708 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 PIM3Q86V86 326 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 C1orf87Q8N0U7 546 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 FBXW8Q8N3Y1 598 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 NPEPL1Q8NDH3 523 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM185AQ8NFB2 350 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR14A16Q8NHC5 309 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC20A1Q8WUM9 679 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 PIGBQ92521 554 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.88□□□□□ -1.79
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms