RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 IL26Q9NPH9 171 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 DOCK4Q8N1I0 1966 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 TTC34A8MYJ7 566 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 OR7A17O14581 309 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 IGHA2P01877 340 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 HNF1BP35680 557 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 HMGCLP35914 325 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 LGALS12Q96DT0 336 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ATG10Q9H0Y0 220 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 PRKD3O94806 890 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 IFI30P13284 250 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CD36P16671 472 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ITPKAP23677 461 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 GABRR2P28476 465 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 GNPDA1P46926 289 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 SERPINB10P48595 397 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 SMARCB1Q12824 385 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ZBTB2Q8N680 514 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 S100ZQ8WXG8 99 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 MYLIPQ8WY64 445 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CD160O95971 181 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 HSMCR30P0CW71 290 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 HIST1H2ADP20671 130 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 RPIAP49247 311 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 EMX2Q04743 252 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 NFATC2Q13469 925 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 SBSNQ6UWP8 590 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 PROSER1Q86XN7 944 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ELMOD1Q8N336 334 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ERVK13-1Q9NX77 482 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 EPHB3P54753 998 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 TUBA3CQ13748 450 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 E2F2Q14209 437 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 TCTN1Q2MV58 587 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 TTC23Q5W5X9 447 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 PROX1Q92786 737 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 HOXA2O43364 376 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 STK16O75716 305 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 B3GALT4O96024 378 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 F11P03951 625 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 XKR7Q5GH72 579 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CERS6Q6ZMG9 384 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CADM2Q8N3J6 435 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 DEPDC7Q96QD5 511 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 LHX3Q9UBR4 397 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 RIMKLBQ9ULI2 386 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 SCN4AP35499 1836 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 EFCAB9A8MZ26 197 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 BCKDKO14874 412 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CLCN4P51793 760 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 FOXM1Q08050 763 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 OR8H2Q8N162 312 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms