RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MUC6Q6W4X9 2439 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MUC5ACP98088 5654 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 GLTPD2A6NH11 291 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 F5H423 210 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSPAN4O14817 238 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SURF4O15260 269 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TGFB1I1O43294 461 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ECE2O60344 883 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSC22D2O75157 780 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 KBTBD11O94819 623 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEMA4FO95754 770 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 GH2P01242 217 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGKV1-17P01599 117 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 HIST1H2ABP04908 130 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSG2P11465 335 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 HIST1H2ADP20671 130 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PKLRP30613 574 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ICAM3P32942 547 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR3A2P47893 321 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPL34P49207 117 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARSEP51690 589 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 IST1P53990 364 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 STX17P56962 302 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERVPABLB-1P60509 514 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 NAAAQ02083 359 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBE3AQ05086 875 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF415Q09FC8 603 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSG7Q13046 419 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MELKQ14680 651 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 UPP1Q16831 310 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC35D3Q5M8T2 416 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBXO47Q5MNV8 452 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ELFN2Q5R3F8 820 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF691Q5VV52 312 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 C1orf228Q6PIY5 440 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CARM1Q86X55 608 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 COMMD2Q86X83 199 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CPOQ8IVL8 374 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MKXQ8IYA7 352 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGAP24Q8N264 748 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2L5Q8NG80 312 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 DHX58Q96C10 678 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERLEC1Q96DZ1 483 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SAAL1Q96ER3 474 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 APOPT1Q96IL0 206 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 C4orf45Q96LM5 186 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAAR6Q96RI8 345 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUDCD1Q96RS6 583 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAD9AQ99638 391 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 BTBD10Q9BSF8 475 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAXXQ9BUH6 204 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPR63Q9BZJ6 419 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MARCH7Q9H992 704 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYNNQ9NPC7 610 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 B3GAT1Q9P2W7 334 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLLQ9UGP5 575 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RSPH14Q9UHP6 348 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PNMA2Q9UL42 364 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MOKQ9UQ07 419 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 NEU3Q9UQ49 428 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM231BA6NCW3 169 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 EPOPA6NHQ4 379 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDXKO00764 312 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR10H2O60403 315 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 NDUFS3O75489 264 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRT33AO76009 404 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACSL3O95573 720 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 APBB3O95704 486 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACTL6AO96019 429 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGKV2D-28P01615 120 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGLV1-47P01700 117 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYL1P05976 194 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRKAR1AP10644 381 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CPN1P15169 458 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 EDNRAP25101 427 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PBX3P40426 434 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MNDAP41218 407 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 HTR3AP46098 478 aa0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms