RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334268.8

TRDN-201, Transcript of triadin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 4,770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-201ENST00000334268 PSMC3P17980 439 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TCP1P17987 556 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TACR2P21452 398 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 RABIFP47224 123 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SOX9P48436 509 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ARFIP2P53365 341 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CDH15P55291 814 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 DPYSQ14117 519 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CRY1Q16526 586 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LEXMQ3ZCV2 418 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TFDP3Q5H9I0 405 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TMEM215Q68D42 235 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 NPNTQ6UXI9 565 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 KDM7AQ6ZMT4 941 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 DPPA2Q7Z7J5 298 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 C12orf40Q86WS4 652 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CHSY1Q86X52 802 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LURAP1LQ8IV03 231 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MFSD6LQ8IWD5 586 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 YAF2Q8IY57 180 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LGI2Q8N0V4 545 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ZNF366Q8N895 744 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 GLIS1Q8NBF1 620 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 OR8K5Q8NH50 307 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ACTL9Q8TC94 416 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CPT1CQ8TCG5 803 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ATG4AQ8WYN0 398 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PEX13Q92968 403 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ALG14Q96F25 216 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 NECTIN4Q96NY8 510 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PHF12Q96QT6 1004 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PSD2Q9BQI7 771 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 EPN3Q9H201 632 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 COQ10BQ9H8M1 238 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 DTLQ9NZJ0 730 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ADA2Q9NZK5 511 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 GMNCA6NCL1 334 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CFAP73A6NFT4 308 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 DRGXA6NNA5 263 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PSTPIP1O43586 416 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 NARSO43776 548 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 FZD6O60353 706 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CLEC3AO75596 197 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 RFPL1O75677 317 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 FGGP02679 453 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TUBBP07437 444 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SLC2A3P11169 496 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ITGB6P18564 788 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CD72P21854 359 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PIK3R1P27986 724 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CD1BP29016 333 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MDH1P40925 334 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SCTRP47872 440 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 RFX3P48380 749 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 HSPA7P48741 367 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CCR4P51679 360 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 DYNLT1P63172 113 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ABATP80404 500 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TAP2Q03519 686 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CHRNB3Q05901 458 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LMAN2Q12907 356 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TUBB2AQ13885 445 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 HNF4GQ14541 408 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 DHCR24Q15392 516 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 EFHC2Q5JST6 749 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 C3orf33Q6P1S2 294 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MTFR2Q6P444 385 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TSSK4Q6SA08 328 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 OTOAQ7RTW8 1153 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 HDDC2Q7Z4H3 204 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SNX20Q7Z614 316 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 NRROSQ86YC3 692 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms