RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
YBX1-201ENST00000321358 ZNF678Q5SXM1 525 aa20.4■□□□□ 0.86
YBX1-201ENST00000321358 FAM92BQ6ZTR7 304 aa20.4■□□□□ 0.86
YBX1-201ENST00000321358 CARFQ8N187 725 aa20.4■□□□□ 0.86
YBX1-201ENST00000321358 OR2L3Q8NG85 312 aa20.4■□□□□ 0.86
YBX1-201ENST00000321358 OR4D9Q8NGE8 314 aa20.4■□□□□ 0.86
YBX1-201ENST00000321358 MDM1Q8TC05 714 aa20.4■□□□□ 0.86
YBX1-201ENST00000321358 DYDC1Q8WWB3 177 aa20.4■□□□□ 0.86
YBX1-201ENST00000321358 L3HYPDHQ96EM0 354 aa20.4■□□□□ 0.86
YBX1-201ENST00000321358 MECRQ9BV79 373 aa20.4■□□□□ 0.86
YBX1-201ENST00000321358 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa20.4■□□□□ 0.86
YBX1-201ENST00000321358 C1GALT1Q9NS00 363 aa20.4■□□□□ 0.86
YBX1-201ENST00000321358 GPRC5BQ9NZH0 403 aa20.4■□□□□ 0.86
YBX1-201ENST00000321358 KLHL3Q9UH77 587 aa20.4■□□□□ 0.86
YBX1-201ENST00000321358 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
YBX1-201ENST00000321358 SPTBN4Q9H254 2564 aa20.4■□□□□ 0.86
YBX1-201ENST00000321358 A0A0J9YY10 115 aa20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TLCD2A6NGC4 264 aa20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 H3BQF6 201 aa20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 GIPC1O14908 333 aa20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 DHRS4L1P0CG22 281 aa20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PSMB5P28074 263 aa20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 GTF2H2Q13888 395 aa20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TRIM42Q8IWZ5 723 aa20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TMEM237Q96Q45 408 aa20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 NUDT22Q9BRQ3 303 aa20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 RTKNQ9BST9 563 aa20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 E2F3O00716 465 aa20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CHN1P15882 459 aa20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ARL4DP49703 201 aa20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 GFERP55789 205 aa20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 WDR4P57081 412 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 SNAP47Q5SQN1 464 aa20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CACHD1Q5VU97 1274 aa20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 SLC5A11Q8WWX8 675 aa20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 OR4K3Q96R72 315 aa20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TWSG1Q9GZX9 223 aa20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 SEMA6CQ9H3T2 930 aa20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 IPPKQ9H8X2 491 aa20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PCTPQ9UKL6 214 aa20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 SNX7Q9UNH6 387 aa20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ASB1Q9Y576 335 aa20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 D6RAR5 112 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 MLYCDO95822 493 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 C9P02748 559 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 RPS17P08708 135 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CSF2RBP32927 897 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PPP1CAP62136 330 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CFHR1Q03591 330 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 RBBP7Q16576 425 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 UNC50Q53HI1 259 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ADCK2Q7Z695 626 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ZUFSPQ96AP4 578 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 MAP3K3Q99759 626 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 MPSTP25325 297 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 GRK3P35626 688 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ATP1A2P50993 1020 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CCR8P51685 355 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CCNG1P51959 295 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 IRF8Q02556 426 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CLCQ05315 142 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CHI3L2Q15782 390 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TRIM73Q86UV7 250 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 NEIL2Q969S2 332 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CNDP1Q96KN2 507 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 DPH7Q9BTV6 452 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TRMOQ9BU70 441 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CEP250Q9BV73 2442 aa20.37■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 A8MU76 341 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 OTCP00480 354 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CDH1P12830 882 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 GRK2P25098 689 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 SERPINB5P36952 375 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 CDH13P55290 713 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 XKR6Q5GH73 641 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 PHF19Q5T6S3 580 aa20.36■□□□□ 0.85
YBX1-201ENST00000321358 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms