RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 ARHGDIAP52565 204 aa24.58■■□□□ 1.53
SENP3-201ENST00000321337 CLDN8P56748 225 aa24.58■■□□□ 1.53
SENP3-201ENST00000321337 ZXDBP98169 803 aa24.58■■□□□ 1.53
SENP3-201ENST00000321337 NPRL3Q12980 569 aa24.58■■□□□ 1.53
SENP3-201ENST00000321337 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SENP3-201ENST00000321337 UBE2UQ5VVX9 321 aa24.58■■□□□ 1.53
SENP3-201ENST00000321337 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SENP3-201ENST00000321337 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SENP3-201ENST00000321337 NLGN4XQ8N0W4 816 aa24.58■■□□□ 1.53
SENP3-201ENST00000321337 APIPQ96GX9 242 aa24.58■■□□□ 1.53
SENP3-201ENST00000321337 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SENP3-201ENST00000321337 ADGRE3Q9BY15 652 aa24.58■■□□□ 1.53
SENP3-201ENST00000321337 MARCH7Q9H992 704 aa24.58■■□□□ 1.53
SENP3-201ENST00000321337 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SENP3-201ENST00000321337 ERVW-1Q9UQF0 538 aa24.58■■□□□ 1.53
SENP3-201ENST00000321337 RNF6Q9Y252 685 aa24.58■■□□□ 1.53
SENP3-201ENST00000321337 FKBP9O95302 570 aa24.58■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 GJB5O95377 273 aa24.58■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 VNN2O95498 520 aa24.58■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 SDC1P18827 310 aa24.58■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 NUDT6P53370 316 aa24.58■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa24.58■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 CDADC1Q9BWV3 514 aa24.58■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 TMEM184CQ9NVA4 438 aa24.58■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 SPATA7Q9P0W8 599 aa24.58■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa24.58■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 A8MX80 341 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 PRAMEF1O95521 474 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 SEMG1P04279 462 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 PPP3CCP48454 512 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 RING1Q06587 406 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 CYP2U1Q7Z449 544 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 PARP16Q8N5Y8 322 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 TRPV1Q8NER1 839 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 COPS4Q9BT78 406 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 EBPLQ9BY08 206 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 NOX1Q9Y5S8 564 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 RHOCP08134 193 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 EPB42P16452 691 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 ZZZ3Q8IYH5 903 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 METTL4Q8N3J2 472 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 CARNMT1Q8N4J0 409 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 NTMT1Q9BV86 223 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 OR51E2Q9H255 320 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 ASIC5Q9NY37 505 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 TRPS1Q9UHF7 1281 aa24.57■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 KCNK5O95279 499 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 KLKB1P03952 638 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 EBLN1P0CF75 366 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 ENGP17813 658 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 PROX2Q3B8N5 592 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 TPRG1LQ5T0D9 272 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 PTOV1Q86YD1 416 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 TPD52L3Q96J77 140 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 MMP27Q9H306 513 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 NTRK1P04629 796 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 NUDT7P0C024 238 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 COL6A1P12109 1028 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 ALOX12P18054 663 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 CASP3P42574 277 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 SEMG2Q02383 582 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 CLLU1OSQ5K130 101 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 HEATR4Q86WZ0 1026 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 STK40Q8N2I9 435 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 SELENOMQ8WWX9 145 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 ATL1Q8WXF7 558 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 WBP2Q969T9 261 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 LATS2Q9NRM7 1088 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 GKN1Q9NS71 199 aa24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 M0R129 80 aa24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 KDELR2P33947 212 aa24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 CDH4P55283 916 aa24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 C5orf22Q49AR2 442 aa24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 GDPD3Q7L5L3 318 aa24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 TBC1D20Q96BZ9 403 aa24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 APOLD1Q96LR9 279 aa24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 TESMINQ9Y4I5 508 aa24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 SF1Q15637 639 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 TIGD6Q17RP2 521 aa24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 VMACQ2NL98 169 aa24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 NCEH1Q6PIU2 408 aa24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 CCDC103Q8IW40 242 aa24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 Q96MT0 163 aa24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 ASB8Q9H765 288 aa24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa24.55■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 CLIC1O00299 241 aa24.54■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 WDR47O94967 919 aa24.54■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 AQP1P29972 269 aa24.54■■□□□ 1.52
SENP3-201ENST00000321337 CYP4F2P78329 520 aa24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms